26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3558 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3558  hypothetical protein  100 
 
 
67 aa  131  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.128976  normal  0.644683 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3851  hypothetical protein  91.04 
 
 
67 aa  121  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.571493 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4007  hypothetical protein  87.69 
 
 
65 aa  111  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2529  hypothetical protein  74.58 
 
 
67 aa  89  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.677101 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4882  hypothetical protein  53.45 
 
 
64 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3030  hypothetical protein  58.73 
 
 
66 aa  57.8  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448488  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1901  hypothetical protein  58.49 
 
 
67 aa  57.4  0.00000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.963466  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4204  hypothetical protein  48.28 
 
 
65 aa  56.2  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5234  hypothetical protein  49.18 
 
 
64 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13626  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1679  hypoxia induced protein region  51.79 
 
 
61 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4850  hypoxia induced protein region  51.79 
 
 
61 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.784963  normal  0.144066 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1818  Hypoxia induced protein conserved region  53.85 
 
 
61 aa  52  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.224413  normal  0.151751 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1538  hypoxia induced protein region  53.85 
 
 
61 aa  52  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.14295 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2162  hypothetical protein  49.12 
 
 
64 aa  51.2  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.241821  normal  0.380203 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2957  hypoxia induced protein region  53.85 
 
 
61 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1138  hypothetical protein  50 
 
 
64 aa  50.8  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1790  hypothetical protein  53.19 
 
 
53 aa  50.4  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.000379179  normal  0.096262 
 
 
-
 
NC_004310  BR1976  hypothetical protein  58.7 
 
 
55 aa  50.4  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1006  hypothetical protein  61.9 
 
 
67 aa  48.9  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0751  hypothetical protein  53.49 
 
 
64 aa  47.8  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3483  hypothetical protein  48.84 
 
 
65 aa  47.4  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0928  hypoxia induced protein region  54.05 
 
 
79 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1705  Hypoxia induced protein conserved region  64.71 
 
 
61 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0817  hypoxia induced protein region  56.76 
 
 
76 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1050  hypothetical protein  37.7 
 
 
65 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.474983  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1612  hypoxia induced protein region  58.33 
 
 
63 aa  41.2  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.901174  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>