28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1538 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1538  hypoxia induced protein region  100 
 
 		 61 aa  114  5e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.14295 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1818  Hypoxia induced protein conserved region  100 
 
 		 61 aa  114  5e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.224413  normal  0.151751 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2957  hypoxia induced protein region  81.97 
 
 		 61 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1679  hypoxia induced protein region  80.33 
 
 		 61 aa  99  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4850  hypoxia induced protein region  81.97 
 
 		 61 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.784963  normal  0.144066 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1705  Hypoxia induced protein conserved region  95.08 
 
 		 61 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0148  hypothetical protein  60 
 
 		 64 aa  65.5  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4204  hypothetical protein  57.69 
 
 		 65 aa  64.3  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1138  hypothetical protein  65.31 
 
 		 64 aa  62  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4882  hypothetical protein  67.31 
 
 		 64 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5234  hypothetical protein  66.67 
 
 		 64 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13626  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1901  hypothetical protein  54.9 
 
 		 67 aa  60.5  0.000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.963466  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0751  hypothetical protein  75 
 
 		 64 aa  60.1  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3814  hypothetical protein  71.79 
 
 		 62 aa  56.6  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0475962 
 
 
-
 
NC_004310  BR1976  hypothetical protein  55.32 
 
 		 55 aa  54.3  0.0000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1006  hypothetical protein  56.1 
 
 		 67 aa  54.3  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3483  hypothetical protein  62.5 
 
 		 65 aa  54.3  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0928  hypoxia induced protein region  74.29 
 
 		 79 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1790  hypothetical protein  60 
 
 		 53 aa  52  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.000379179  normal  0.096262 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3558  hypothetical protein  53.85 
 
 		 67 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.128976  normal  0.644683 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3030  hypothetical protein  60.98 
 
 		 66 aa  51.2  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448488  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0817  hypoxia induced protein region  71.43 
 
 		 76 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3851  hypothetical protein  61.36 
 
 		 67 aa  50.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.571493 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4007  hypothetical protein  59.09 
 
 		 65 aa  49.7  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2162  hypothetical protein  56.25 
 
 		 64 aa  48.9  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.241821  normal  0.380203 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1612  hypoxia induced protein region  83.33 
 
 		 63 aa  48.1  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.901174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2529  hypothetical protein  55.77 
 
 		 67 aa  47.4  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.677101 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1050  hypothetical protein  44.83 
 
 		 65 aa  44.3  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.474983  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>