20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2162 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2162  hypothetical protein  100 
 
 		 64 aa  123  8.000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.241821  normal  0.380203 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4882  hypothetical protein  54.39 
 
 		 64 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5234  hypothetical protein  58.18 
 
 		 64 aa  62.8  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13626  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4204  hypothetical protein  53.57 
 
 		 65 aa  63.5  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1138  hypothetical protein  52.73 
 
 		 64 aa  57.8  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3851  hypothetical protein  50.88 
 
 		 67 aa  57  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.571493 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1790  hypothetical protein  57.14 
 
 		 53 aa  55.5  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.000379179  normal  0.096262 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3483  hypothetical protein  52.63 
 
 		 65 aa  53.5  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2529  hypothetical protein  55.77 
 
 		 67 aa  52  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.677101 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3558  hypothetical protein  49.12 
 
 		 67 aa  51.2  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.128976  normal  0.644683 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4007  hypothetical protein  48.08 
 
 		 65 aa  50.8  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1538  hypoxia induced protein region  56.25 
 
 		 61 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.14295 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1818  Hypoxia induced protein conserved region  56.25 
 
 		 61 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.224413  normal  0.151751 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0751  hypothetical protein  52.27 
 
 		 64 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0817  hypoxia induced protein region  55.26 
 
 		 76 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2957  hypoxia induced protein region  60 
 
 		 61 aa  47  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0928  hypoxia induced protein region  55.26 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4850  hypoxia induced protein region  57.45 
 
 		 61 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.784963  normal  0.144066 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1679  hypoxia induced protein region  51.92 
 
 		 61 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0148  hypothetical protein  50 
 
 		 64 aa  45.1  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>