30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0817 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0817  hypoxia induced protein region  100 
 
 		 76 aa  149  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5234  hypothetical protein  84.38 
 
 		 64 aa  110  9e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13626  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4882  hypothetical protein  84.38 
 
 		 64 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0928  hypoxia induced protein region  85.53 
 
 		 79 aa  102  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1138  hypothetical protein  70.31 
 
 		 64 aa  94  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4204  hypothetical protein  65.08 
 
 		 65 aa  84  6e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3483  hypothetical protein  64.06 
 
 		 65 aa  81.3  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0751  hypothetical protein  62.5 
 
 		 64 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2162  hypothetical protein  55.36 
 
 		 64 aa  63.5  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.241821  normal  0.380203 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2957  hypoxia induced protein region  67.27 
 
 		 61 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0148  hypothetical protein  59.18 
 
 		 64 aa  63.2  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1538  hypoxia induced protein region  67.31 
 
 		 61 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.14295 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1818  Hypoxia induced protein conserved region  67.31 
 
 		 61 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.224413  normal  0.151751 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1679  hypoxia induced protein region  69.39 
 
 		 61 aa  62  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1790  hypothetical protein  61.22 
 
 		 53 aa  61.6  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.000379179  normal  0.096262 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4850  hypoxia induced protein region  65.38 
 
 		 61 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.784963  normal  0.144066 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4007  hypothetical protein  52.38 
 
 		 65 aa  58.2  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3851  hypothetical protein  51.72 
 
 		 67 aa  57.4  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.571493 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3558  hypothetical protein  53.45 
 
 		 67 aa  54.3  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.128976  normal  0.644683 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1612  hypoxia induced protein region  68.42 
 
 		 63 aa  53.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.901174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1901  hypothetical protein  51.02 
 
 		 67 aa  51.6  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.963466  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2529  hypothetical protein  47.62 
 
 		 67 aa  51.2  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.677101 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3814  hypothetical protein  64.1 
 
 		 62 aa  51.2  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0475962 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1050  hypothetical protein  48.33 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.474983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1705  Hypoxia induced protein conserved region  73.53 
 
 		 61 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3030  hypothetical protein  64.86 
 
 		 66 aa  48.9  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448488  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1006  hypothetical protein  52.5 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1976  hypothetical protein  48.89 
 
 		 55 aa  44.3  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2356  hypoxia induced protein region  50 
 
 		 68 aa  42.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.43014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1486  hypothetical protein  46.67 
 
 		 61 aa  40.8  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>