28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1006 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_1006  hypothetical protein  100 
 
 
67 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1901  hypothetical protein  89.55 
 
 
67 aa  118  3e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.963466  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1976  hypothetical protein  87.27 
 
 
55 aa  94.7  4e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4850  hypoxia induced protein region  58.82 
 
 
61 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.784963  normal  0.144066 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2957  hypoxia induced protein region  56.86 
 
 
61 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1679  hypoxia induced protein region  58.82 
 
 
61 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1818  Hypoxia induced protein conserved region  54.9 
 
 
61 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.224413  normal  0.151751 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1538  hypoxia induced protein region  54.9 
 
 
61 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.14295 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3851  hypothetical protein  56.6 
 
 
67 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.571493 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3558  hypothetical protein  58.49 
 
 
67 aa  57.4  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.128976  normal  0.644683 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3030  hypothetical protein  67.5 
 
 
66 aa  57  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448488  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4007  hypothetical protein  54.72 
 
 
65 aa  56.2  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5234  hypothetical protein  57.14 
 
 
64 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13626  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2529  hypothetical protein  49.15 
 
 
67 aa  54.7  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.677101 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4882  hypothetical protein  55.1 
 
 
64 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1138  hypothetical protein  53.06 
 
 
64 aa  53.9  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4204  hypothetical protein  46.94 
 
 
65 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0148  hypothetical protein  50 
 
 
64 aa  51.2  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1705  Hypoxia induced protein conserved region  57.14 
 
 
61 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0751  hypothetical protein  52.27 
 
 
64 aa  48.9  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1790  hypothetical protein  53.19 
 
 
53 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.000379179  normal  0.096262 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1050  hypothetical protein  36.92 
 
 
65 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.474983  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2356  hypoxia induced protein region  44.12 
 
 
68 aa  47  0.00009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.43014  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0219  hypothetical protein  40.68 
 
 
71 aa  45.4  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3483  hypothetical protein  46.67 
 
 
65 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3814  hypothetical protein  54.29 
 
 
62 aa  43.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0475962 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1612  hypoxia induced protein region  47.37 
 
 
63 aa  40.8  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.901174  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0928  hypoxia induced protein region  50 
 
 
79 aa  40.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>