27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_4007 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_4007  hypothetical protein  100 
 
 		 65 aa  123  7e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3558  hypothetical protein  87.69 
 
 		 67 aa  111  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.128976  normal  0.644683 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3851  hypothetical protein  84.62 
 
 		 67 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.571493 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2529  hypothetical protein  72.31 
 
 		 67 aa  93.6  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.677101 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4882  hypothetical protein  53.97 
 
 		 64 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5234  hypothetical protein  52.38 
 
 		 64 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13626  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3030  hypothetical protein  58.73 
 
 		 66 aa  57  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448488  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4204  hypothetical protein  49.15 
 
 		 65 aa  57  0.00000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1901  hypothetical protein  56.6 
 
 		 67 aa  55.1  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.963466  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4850  hypoxia induced protein region  56.25 
 
 		 61 aa  52  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.784963  normal  0.144066 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1679  hypoxia induced protein region  49.21 
 
 		 61 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1138  hypothetical protein  53.85 
 
 		 64 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2957  hypoxia induced protein region  55.93 
 
 		 61 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2162  hypothetical protein  48.08 
 
 		 64 aa  50.8  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.241821  normal  0.380203 
 
 
-
 
NC_004310  BR1976  hypothetical protein  56.52 
 
 		 55 aa  50.4  0.000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1818  Hypoxia induced protein conserved region  59.09 
 
 		 61 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.224413  normal  0.151751 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3483  hypothetical protein  46.03 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1538  hypoxia induced protein region  59.09 
 
 		 61 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.14295 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1790  hypothetical protein  51.06 
 
 		 53 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.000379179  normal  0.096262 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1006  hypothetical protein  57.14 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0751  hypothetical protein  51.16 
 
 		 64 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0928  hypoxia induced protein region  51.35 
 
 		 79 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0817  hypoxia induced protein region  56.76 
 
 		 76 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1050  hypothetical protein  37.7 
 
 		 65 aa  43.9  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.474983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1705  Hypoxia induced protein conserved region  58.82 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2356  hypoxia induced protein region  50 
 
 		 68 aa  42  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.43014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1612  hypoxia induced protein region  55.56 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.901174  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>