23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1976 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR1976  hypothetical protein  100 
 
 		 55 aa  108  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1901  hypothetical protein  98.18 
 
 		 67 aa  104  5e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.963466  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1006  hypothetical protein  87.5 
 
 		 67 aa  84.7  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4850  hypoxia induced protein region  57.45 
 
 		 61 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.784963  normal  0.144066 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2957  hypoxia induced protein region  55.32 
 
 		 61 aa  57  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1679  hypoxia induced protein region  55.32 
 
 		 61 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1538  hypoxia induced protein region  55.32 
 
 		 61 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.14295 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1818  Hypoxia induced protein conserved region  55.32 
 
 		 61 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.224413  normal  0.151751 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3851  hypothetical protein  60.87 
 
 		 67 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.571493 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3030  hypothetical protein  60 
 
 		 66 aa  51.6  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448488  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3558  hypothetical protein  58.7 
 
 		 67 aa  50.4  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.128976  normal  0.644683 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4007  hypothetical protein  56.52 
 
 		 65 aa  50.4  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1138  hypothetical protein  53.33 
 
 		 64 aa  48.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4882  hypothetical protein  48.89 
 
 		 64 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0148  hypothetical protein  50 
 
 		 64 aa  47.4  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5234  hypothetical protein  51.11 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13626  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1050  hypothetical protein  43.14 
 
 		 65 aa  46.2  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.474983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1705  Hypoxia induced protein conserved region  51.43 
 
 		 61 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4204  hypothetical protein  44.44 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2529  hypothetical protein  52.27 
 
 		 67 aa  45.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.677101 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1790  hypothetical protein  46.81 
 
 		 53 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.000379179  normal  0.096262 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0751  hypothetical protein  50 
 
 		 64 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3814  hypothetical protein  52.94 
 
 		 62 aa  40.4  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0475962 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>