21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1050 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1050  hypothetical protein  100 
 
 
65 aa  132  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.474983  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2356  hypoxia induced protein region  50 
 
 
68 aa  60.1  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.43014  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1901  hypothetical protein  43.08 
 
 
67 aa  53.1  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.963466  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4882  hypothetical protein  46.67 
 
 
64 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1138  hypothetical protein  48.33 
 
 
64 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4204  hypothetical protein  41.67 
 
 
65 aa  50.4  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2957  hypoxia induced protein region  44.07 
 
 
61 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4850  hypoxia induced protein region  44.83 
 
 
61 aa  47.4  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.784963  normal  0.144066 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1679  hypoxia induced protein region  43.1 
 
 
61 aa  47  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0219  hypothetical protein  46 
 
 
71 aa  46.2  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0148  hypothetical protein  37.5 
 
 
64 aa  46.6  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1976  hypothetical protein  43.14 
 
 
55 aa  46.2  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3851  hypothetical protein  39.34 
 
 
67 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.571493 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5234  hypothetical protein  41.67 
 
 
64 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13626  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1538  hypoxia induced protein region  44.83 
 
 
61 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.14295 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1818  Hypoxia induced protein conserved region  44.83 
 
 
61 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.224413  normal  0.151751 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4007  hypothetical protein  37.7 
 
 
65 aa  43.9  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3030  hypothetical protein  41.27 
 
 
66 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448488  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3558  hypothetical protein  37.7 
 
 
67 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.128976  normal  0.644683 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1006  hypothetical protein  39.13 
 
 
67 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1705  Hypoxia induced protein conserved region  51.35 
 
 
61 aa  40.4  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>