26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1336 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1336  hypothetical protein  100 
 
 		 362 aa  720    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.251495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0940  hypothetical protein  50.36 
 
 		 350 aa  210  2e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1765  hypothetical protein  54.55 
 
 		 323 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3399  hypothetical protein  46.36 
 
 		 347 aa  195  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.274598  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3949  hypothetical protein  49.47 
 
 		 325 aa  192  7e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.315669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3710  hypothetical protein  48.33 
 
 		 323 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.483452 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6682  hypothetical protein  33.96 
 
 		 567 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2933  hypothetical protein  33.16 
 
 		 297 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3351  hypothetical protein  34.87 
 
 		 349 aa  82  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0015  hypothetical protein  30.77 
 
 		 290 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0018  hypothetical protein  31.71 
 
 		 278 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0016  hypothetical protein  32.45 
 
 		 273 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.571689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0017  hypothetical protein  30.15 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0010  hypothetical protein  32.68 
 
 		 293 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0777049 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0663  hypothetical protein  33.58 
 
 		 305 aa  66.6  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.582224 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1125  hypothetical protein  34.09 
 
 		 283 aa  53.1  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.730205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0653  hypothetical protein  40.62 
 
 		 188 aa  49.7  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.344221 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0690  hypothetical protein  39.76 
 
 		 189 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.154988  normal  0.145005 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0254  hypothetical protein  44.9 
 
 		 190 aa  47.4  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0732  hypothetical protein  31.53 
 
 		 161 aa  47.4  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0348  hypothetical protein  44 
 
 		 180 aa  47.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0447096 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0316  conserved hypothetical conserved membrane protein  42 
 
 		 180 aa  46.2  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.576335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6501  hypothetical protein  42.59 
 
 		 208 aa  45.8  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0056  hypothetical protein  37.5 
 
 		 219 aa  45.1  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.848105 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0679  hypothetical protein  37.84 
 
 		 189 aa  45.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2869  Peptidase M23  31.45 
 
 		 373 aa  42.7  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>