21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0010 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_0010  hypothetical protein  100 
 
 
293 aa  555  1e-157  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0777049 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0015  hypothetical protein  67.77 
 
 
290 aa  355  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0016  hypothetical protein  42.86 
 
 
273 aa  160  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.571689  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2933  hypothetical protein  38.74 
 
 
297 aa  144  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0018  hypothetical protein  37.76 
 
 
278 aa  137  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0017  hypothetical protein  36.1 
 
 
278 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3949  hypothetical protein  40.91 
 
 
325 aa  93.6  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.315669  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3351  hypothetical protein  34.54 
 
 
349 aa  90.5  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3399  hypothetical protein  34.63 
 
 
347 aa  88.2  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.274598  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1765  hypothetical protein  34.15 
 
 
323 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3710  hypothetical protein  39.08 
 
 
323 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.483452 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0940  hypothetical protein  38.19 
 
 
350 aa  77.4  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0663  hypothetical protein  42.11 
 
 
305 aa  75.9  0.0000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.582224 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1336  hypothetical protein  31.19 
 
 
362 aa  70.1  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.251495  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0653  hypothetical protein  41.11 
 
 
188 aa  65.9  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.344221 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0690  hypothetical protein  41.11 
 
 
189 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.154988  normal  0.145005 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6682  hypothetical protein  53.45 
 
 
567 aa  63.2  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0679  hypothetical protein  38.89 
 
 
189 aa  59.3  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6501  hypothetical protein  43.82 
 
 
208 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3584  hypothetical protein  31.87 
 
 
166 aa  46.2  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1125  hypothetical protein  33.07 
 
 
283 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.730205  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>