25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3351 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3351  hypothetical protein  100 
 
 		 349 aa  694    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0663  hypothetical protein  31.2 
 
 		 305 aa  89.7  6e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.582224 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3949  hypothetical protein  33.88 
 
 		 325 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.315669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1765  hypothetical protein  34.76 
 
 		 323 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1336  hypothetical protein  34.36 
 
 		 362 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.251495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0010  hypothetical protein  36.24 
 
 		 293 aa  77  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0777049 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0940  hypothetical protein  31.05 
 
 		 350 aa  75.1  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0015  hypothetical protein  56.9 
 
 		 290 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2933  hypothetical protein  29.63 
 
 		 297 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3399  hypothetical protein  32.6 
 
 		 347 aa  70.5  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.274598  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3710  hypothetical protein  29.63 
 
 		 323 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.483452 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0018  hypothetical protein  32.14 
 
 		 278 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0016  hypothetical protein  30.95 
 
 		 273 aa  66.6  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.571689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0017  hypothetical protein  51.85 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6682  hypothetical protein  47.54 
 
 		 567 aa  62  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6501  hypothetical protein  49.15 
 
 		 208 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0690  hypothetical protein  42.59 
 
 		 189 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.154988  normal  0.145005 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0679  hypothetical protein  42.59 
 
 		 189 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0653  hypothetical protein  35.56 
 
 		 188 aa  52.8  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.344221 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1125  hypothetical protein  38.98 
 
 		 283 aa  50.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.730205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0056  hypothetical protein  37.5 
 
 		 219 aa  45.1  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.848105 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0732  hypothetical protein  35.29 
 
 		 161 aa  44.3  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0316  conserved hypothetical conserved membrane protein  37.74 
 
 		 180 aa  43.1  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.576335  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0348  hypothetical protein  37.74 
 
 		 180 aa  43.1  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0447096 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3584  hypothetical protein  30.63 
 
 		 166 aa  42.7  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>