20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0732 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0732  hypothetical protein  100 
 
 		 161 aa  333  7e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0348  hypothetical protein  59.88 
 
 		 180 aa  189  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0447096 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0316  conserved hypothetical conserved membrane protein  58.39 
 
 		 180 aa  186  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.576335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0254  hypothetical protein  47.2 
 
 		 190 aa  155  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0299  hypothetical protein  38.61 
 
 		 201 aa  95.1  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4213  hypothetical protein  29.48 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0130  hypothetical protein  48.39 
 
 		 172 aa  58.5  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0121  hypothetical protein  48.39 
 
 		 172 aa  58.5  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.844766  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0653  hypothetical protein  34.12 
 
 		 188 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.344221 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0940  hypothetical protein  38.16 
 
 		 350 aa  50.4  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0056  hypothetical protein  43.18 
 
 		 219 aa  50.1  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.848105 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1336  hypothetical protein  42.59 
 
 		 362 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.251495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6501  hypothetical protein  33.33 
 
 		 208 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0679  hypothetical protein  31.82 
 
 		 189 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3399  hypothetical protein  37.04 
 
 		 347 aa  45.1  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.274598  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3351  hypothetical protein  35.29 
 
 		 349 aa  44.3  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0690  hypothetical protein  29.55 
 
 		 189 aa  44.3  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.154988  normal  0.145005 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1765  hypothetical protein  37.04 
 
 		 323 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3584  hypothetical protein  30.91 
 
 		 166 aa  41.6  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3949  hypothetical protein  31.87 
 
 		 325 aa  41.6  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.315669  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>