15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0254 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0254  hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  390  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0348  hypothetical protein  50.27 
 
 		 180 aa  165  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0447096 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0732  hypothetical protein  47.2 
 
 		 161 aa  155  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0316  conserved hypothetical conserved membrane protein  47.51 
 
 		 180 aa  154  9e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.576335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0299  hypothetical protein  36.6 
 
 		 201 aa  93.6  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4213  hypothetical protein  30.3 
 
 		 201 aa  62  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0130  hypothetical protein  38.61 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0121  hypothetical protein  38.61 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.844766  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3399  hypothetical protein  41.67 
 
 		 347 aa  48.9  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.274598  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0056  hypothetical protein  40 
 
 		 219 aa  47.4  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.848105 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1336  hypothetical protein  44.9 
 
 		 362 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.251495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0940  hypothetical protein  44.9 
 
 		 350 aa  45.8  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1765  hypothetical protein  37.5 
 
 		 323 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6682  hypothetical protein  36.54 
 
 		 567 aa  41.6  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3351  hypothetical protein  37.33 
 
 		 349 aa  41.6  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>