18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0316 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0316  conserved hypothetical conserved membrane protein  100 
 
 
180 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.576335  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0348  hypothetical protein  89.44 
 
 
180 aa  310  6.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0447096 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0732  hypothetical protein  58.02 
 
 
161 aa  197  6e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0254  hypothetical protein  47.51 
 
 
190 aa  166  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0299  hypothetical protein  40.26 
 
 
201 aa  105  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4213  hypothetical protein  29.17 
 
 
201 aa  63.2  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0130  hypothetical protein  50 
 
 
172 aa  57.4  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0121  hypothetical protein  50 
 
 
172 aa  57.4  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.844766  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3399  hypothetical protein  38.6 
 
 
347 aa  48.1  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.274598  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1336  hypothetical protein  42 
 
 
362 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.251495  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0940  hypothetical protein  44 
 
 
350 aa  45.8  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3584  hypothetical protein  28.57 
 
 
166 aa  44.7  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1765  hypothetical protein  35.09 
 
 
323 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3351  hypothetical protein  37.74 
 
 
349 aa  43.1  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6682  hypothetical protein  38.78 
 
 
567 aa  42.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0056  hypothetical protein  35 
 
 
219 aa  41.2  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.848105 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0679  hypothetical protein  25.53 
 
 
189 aa  41.2  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0690  hypothetical protein  25.53 
 
 
189 aa  41.2  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.154988  normal  0.145005 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>