18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3710 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3710  hypothetical protein  100 
 
 		 323 aa  635    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.483452 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3949  hypothetical protein  73.48 
 
 		 325 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.315669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1765  hypothetical protein  57.58 
 
 		 323 aa  273  3e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1336  hypothetical protein  45.29 
 
 		 362 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.251495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3399  hypothetical protein  43.55 
 
 		 347 aa  186  5e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.274598  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0940  hypothetical protein  44.49 
 
 		 350 aa  171  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6682  hypothetical protein  38.7 
 
 		 567 aa  142  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0015  hypothetical protein  36.8 
 
 		 290 aa  85.9  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3351  hypothetical protein  33.47 
 
 		 349 aa  84  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0016  hypothetical protein  33.33 
 
 		 273 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.571689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0018  hypothetical protein  33.16 
 
 		 278 aa  75.9  0.0000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2933  hypothetical protein  32.63 
 
 		 297 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0663  hypothetical protein  32.16 
 
 		 305 aa  73.6  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.582224 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0017  hypothetical protein  33.51 
 
 		 278 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0010  hypothetical protein  35.22 
 
 		 293 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0777049 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1125  hypothetical protein  32.73 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.730205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6501  hypothetical protein  38.71 
 
 		 208 aa  44.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0653  hypothetical protein  39.66 
 
 		 188 aa  43.5  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.344221 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>