51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0663 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0663  proline dehydrogenase  100 
 
 		 306 aa  619  1e-176  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.364988 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0599  Proline dehydrogenase  23.61 
 
 		 306 aa  82  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2524  Proline dehydrogenase  25.76 
 
 		 307 aa  76.6  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.30854  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2465  proline dehydrogenase  26.21 
 
 		 319 aa  72.4  0.000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2923  L-proline dehydrogenase  25.26 
 
 		 306 aa  68.9  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5008  proline dehydrogenase  24.72 
 
 		 271 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1338  L-proline dehydrogenase  23.55 
 
 		 306 aa  63.5  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0346  proline dehydrogenase  24.16 
 
 		 318 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.417715  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0662  Proline dehydrogenase  28.52 
 
 		 331 aa  62.8  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3090  Proline dehydrogenase  24.3 
 
 		 305 aa  62.8  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0351  Proline dehydrogenase  27.64 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0346031  normal  0.177758 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5760  Proline dehydrogenase  27.37 
 
 		 306 aa  60.5  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3124  Proline dehydrogenase  26.71 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.206513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2929  Proline dehydrogenase  30.47 
 
 		 278 aa  58.9  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2939  Proline dehydrogenase  22.71 
 
 		 305 aa  58.9  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0183  Proline dehydrogenase  25.34 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4483  Proline dehydrogenase  30.39 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2640  Proline dehydrogenase  23.1 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4255  L-proline dehydrogenase  25.25 
 
 		 318 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.136465 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4054  Proline dehydrogenase  23.57 
 
 		 279 aa  54.7  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4100  L-proline dehydrogenase  25.25 
 
 		 318 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4025  L-proline dehydrogenase  25.25 
 
 		 318 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0434  L-proline dehydrogenase  25.25 
 
 		 311 aa  54.3  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1424  Proline dehydrogenase  30.11 
 
 		 311 aa  53.1  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0568562  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0248  L-proline dehydrogenase  24.3 
 
 		 317 aa  52.8  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.529478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0851  proline dehydrogenase  26.51 
 
 		 310 aa  52.4  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.435625  normal  0.094276 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4736  proline dehydrogenase  20.56 
 
 		 305 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4721  proline dehydrogenase  20.56 
 
 		 305 aa  51.6  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5121  proline dehydrogenase family protein  20.56 
 
 		 305 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5159  proline dehydrogenase family protein  20.56 
 
 		 305 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3600  proline dehydrogenase  20.24 
 
 		 305 aa  51.2  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5148  proline dehydrogenase family protein  20.56 
 
 		 305 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5153  proline dehydrogenase family protein  20.56 
 
 		 305 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4838  proline dehydrogenase  20.87 
 
 		 305 aa  50.8  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02730  L-proline dehydrogenase  25.37 
 
 		 308 aa  50.4  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.655288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0480  L-proline dehydrogenase  25.77 
 
 		 316 aa  50.8  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1511  proline dehydrogenase  27.24 
 
 		 302 aa  50.4  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0091  proline dehydrogenase family protein  20.87 
 
 		 305 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4879  proline dehydrogenase family protein  20.87 
 
 		 305 aa  50.1  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5253  proline dehydrogenase family protein  20.87 
 
 		 305 aa  50.1  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0498834  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0342  proline dehydrogenase  26.33 
 
 		 305 aa  49.3  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0992788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0309  hypothetical protein  26.75 
 
 		 323 aa  49.3  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1081  Proline dehydrogenase  27.64 
 
 		 307 aa  49.3  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.962352  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0496  Proline dehydrogenase  24.39 
 
 		 279 aa  49.3  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8354  Proline dehydrogenase  26.67 
 
 		 309 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4525  proline dehydrogenase  26.47 
 
 		 320 aa  45.8  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1500  L-proline dehydrogenase  22.18 
 
 		 306 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.49139  normal  0.510796 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1107  Proline dehydrogenase  26.69 
 
 		 277 aa  44.7  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.000219006  normal  0.0483795 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0088  L-proline dehydrogenase  25.71 
 
 		 308 aa  43.9  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3332  proline dehydrogenase  22.06 
 
 		 323 aa  43.1  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254194  normal  0.274801 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11212  proline dehydrogenase  30.5 
 
 		 329 aa  42.4  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0207588  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>