24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1516 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1516  hypothetical protein  100 
 
 		 452 aa  926    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.314645  normal  0.315596 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4472  type IV b pilus protein  42.12 
 
 		 441 aa  350  3e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59270  type IV b pilus protein  41.89 
 
 		 441 aa  345  8e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00533868  hitchhiker  0.00000189781 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0015  type IV pilus biogenesis protein PilO2  31 
 
 		 511 aa  235  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0061  putative type IV secretion system protein PilO2  27.17 
 
 		 444 aa  154  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5450  hypothetical protein  26.94 
 
 		 429 aa  100  7e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.752604  normal  0.0236455 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5910  PilO; putative type IV pilus biosynthesis protein  23.35 
 
 		 421 aa  90.5  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.938925  normal  0.0381503 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0770  pilO family protein  25.11 
 
 		 429 aa  87.4  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.15746  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0626  hypothetical protein  24.94 
 
 		 437 aa  81.6  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5879  pilO; putative type IV pilus biosynthesis protein  25.71 
 
 		 438 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.87974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6154  hypothetical protein  27.31 
 
 		 409 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5662  PilO; putative type IV pilus biosynthesis protein  22.76 
 
 		 438 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125237  normal  0.028275 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1535  hypothetical protein  26.56 
 
 		 417 aa  75.5  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.197533  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5200  putative type IV pilus biosynthesis protein  26.56 
 
 		 417 aa  75.5  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1980  putative PilO  25.93 
 
 		 432 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.778405  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2256  putative type IV pilus biogenesis protein  25.93 
 
 		 432 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2172  putative type IV pilus biogenesis protein  25.93 
 
 		 432 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273576  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0659  putative PilO  25.93 
 
 		 432 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.591304  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0656  putative type IV pilus biosynthesis protein  25.93 
 
 		 432 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1609  putative PilO  25.93 
 
 		 432 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.289822  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3733  pilin accessory protein PilO  24.61 
 
 		 445 aa  72.4  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5241  hypothetical protein  27.49 
 
 		 430 aa  67  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0116  PilO protein  24.87 
 
 		 431 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5435  putative component of type II secretion apparatus  24.75 
 
 		 419 aa  44.7  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>