21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMAA1609 on replicon NC_006349
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1609  putative PilO  100 
 
 
432 aa  858    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.289822  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0659  putative PilO  100 
 
 
432 aa  858    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.591304  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2172  putative type IV pilus biogenesis protein  100 
 
 
432 aa  858    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273576  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2256  putative type IV pilus biogenesis protein  100 
 
 
432 aa  858    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1980  putative PilO  100 
 
 
432 aa  858    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.778405  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0770  pilO family protein  92.36 
 
 
429 aa  776    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.15746  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0656  putative type IV pilus biosynthesis protein  100 
 
 
432 aa  858    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5879  pilO; putative type IV pilus biosynthesis protein  51.47 
 
 
438 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.87974  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5910  PilO; putative type IV pilus biosynthesis protein  51.5 
 
 
421 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.938925  normal  0.0381503 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5662  PilO; putative type IV pilus biosynthesis protein  50.8 
 
 
438 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125237  normal  0.028275 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5450  hypothetical protein  27.23 
 
 
429 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.752604  normal  0.0236455 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5241  hypothetical protein  26.33 
 
 
430 aa  108  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59270  type IV b pilus protein  27.74 
 
 
441 aa  106  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00533868  hitchhiker  0.00000189781 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4472  type IV b pilus protein  27.62 
 
 
441 aa  103  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5200  putative type IV pilus biosynthesis protein  30.08 
 
 
417 aa  67.8  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1535  hypothetical protein  30.08 
 
 
417 aa  67.8  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.197533  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1516  hypothetical protein  25.78 
 
 
452 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.314645  normal  0.315596 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5029  hypothetical protein  27.74 
 
 
418 aa  53.9  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0015  type IV pilus biogenesis protein PilO2  29.91 
 
 
511 aa  51.6  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0061  putative type IV secretion system protein PilO2  21.65 
 
 
444 aa  44.3  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5435  putative component of type II secretion apparatus  27.48 
 
 
419 aa  44.3  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>