19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_B0015 on replicon NC_009705
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009705  YpsIP31758_B0015  type IV pilus biogenesis protein PilO2  100 
 
 		 511 aa  1050    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1516  hypothetical protein  29.18 
 
 		 452 aa  178  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.314645  normal  0.315596 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4472  type IV b pilus protein  26.29 
 
 		 441 aa  161  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59270  type IV b pilus protein  26.1 
 
 		 441 aa  157  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00533868  hitchhiker  0.00000189781 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0061  putative type IV secretion system protein PilO2  26.37 
 
 		 444 aa  147  6e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0116  PilO protein  22.35 
 
 		 431 aa  79.3  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3733  pilin accessory protein PilO  23.2 
 
 		 445 aa  68.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5662  PilO; putative type IV pilus biosynthesis protein  29.91 
 
 		 438 aa  60.5  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125237  normal  0.028275 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5879  pilO; putative type IV pilus biosynthesis protein  20.88 
 
 		 438 aa  60.5  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.87974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0626  hypothetical protein  20.86 
 
 		 437 aa  58.9  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6154  hypothetical protein  22.84 
 
 		 409 aa  55.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5910  PilO; putative type IV pilus biosynthesis protein  28.97 
 
 		 421 aa  53.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.938925  normal  0.0381503 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0659  putative PilO  29.91 
 
 		 432 aa  51.6  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.591304  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2172  putative type IV pilus biogenesis protein  29.91 
 
 		 432 aa  51.6  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273576  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2256  putative type IV pilus biogenesis protein  29.91 
 
 		 432 aa  51.6  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1980  putative PilO  29.91 
 
 		 432 aa  51.6  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.778405  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0770  pilO family protein  29.91 
 
 		 429 aa  52  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.15746  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0656  putative type IV pilus biosynthesis protein  29.91 
 
 		 432 aa  51.6  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1609  putative PilO  29.91 
 
 		 432 aa  51.6  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.289822  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>