12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0626 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0626  hypothetical protein  100 
 
 		 437 aa  884    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3733  pilin accessory protein PilO  26.51 
 
 		 445 aa  105  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0116  PilO protein  25.18 
 
 		 431 aa  94  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1516  hypothetical protein  24.49 
 
 		 452 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.314645  normal  0.315596 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59270  type IV b pilus protein  22.42 
 
 		 441 aa  77  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00533868  hitchhiker  0.00000189781 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4472  type IV b pilus protein  22.42 
 
 		 441 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0015  type IV pilus biogenesis protein PilO2  20.86 
 
 		 511 aa  70.5  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0061  putative type IV secretion system protein PilO2  21.8 
 
 		 444 aa  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5879  pilO; putative type IV pilus biosynthesis protein  26.73 
 
 		 438 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.87974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5910  PilO; putative type IV pilus biosynthesis protein  24.18 
 
 		 421 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.938925  normal  0.0381503 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1535  hypothetical protein  24.38 
 
 		 417 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.197533  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5200  putative type IV pilus biosynthesis protein  24.38 
 
 		 417 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>