12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_A0061 on replicon NC_009704
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009704  YpsIP31758_A0061  putative type IV secretion system protein PilO2  100 
 
 		 444 aa  907    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4472  type IV b pilus protein  27.09 
 
 		 441 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59270  type IV b pilus protein  27.31 
 
 		 441 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00533868  hitchhiker  0.00000189781 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0015  type IV pilus biogenesis protein PilO2  26.37 
 
 		 511 aa  169  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1516  hypothetical protein  26.29 
 
 		 452 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.314645  normal  0.315596 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0116  PilO protein  26.8 
 
 		 431 aa  83.6  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3733  pilin accessory protein PilO  23.58 
 
 		 445 aa  72.4  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6154  hypothetical protein  23.15 
 
 		 409 aa  51.6  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0626  hypothetical protein  21.76 
 
 		 437 aa  51.6  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5910  PilO; putative type IV pilus biosynthesis protein  21.15 
 
 		 421 aa  49.7  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.938925  normal  0.0381503 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5450  hypothetical protein  20.9 
 
 		 429 aa  46.6  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.752604  normal  0.0236455 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0770  pilO family protein  22.96 
 
 		 429 aa  45.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.15746  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>