17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_5200 on replicon NC_012849
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012849  Rpic12D_5200  putative type IV pilus biosynthesis protein  100 
 
 		 417 aa  844    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1535  hypothetical protein  100 
 
 		 417 aa  844    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.197533  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5435  putative component of type II secretion apparatus  40.05 
 
 		 419 aa  268  2e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5029  hypothetical protein  39.33 
 
 		 418 aa  261  2e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5879  pilO; putative type IV pilus biosynthesis protein  30.05 
 
 		 438 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.87974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5662  PilO; putative type IV pilus biosynthesis protein  30.07 
 
 		 438 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125237  normal  0.028275 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0770  pilO family protein  29.67 
 
 		 429 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.15746  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4472  type IV b pilus protein  23.08 
 
 		 441 aa  56.6  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2172  putative type IV pilus biogenesis protein  28.39 
 
 		 432 aa  53.9  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273576  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0659  putative PilO  28.39 
 
 		 432 aa  53.9  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.591304  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1609  putative PilO  28.39 
 
 		 432 aa  53.9  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.289822  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2256  putative type IV pilus biogenesis protein  28.39 
 
 		 432 aa  53.9  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1980  putative PilO  28.39 
 
 		 432 aa  53.9  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.778405  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0656  putative type IV pilus biosynthesis protein  28.39 
 
 		 432 aa  53.9  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5910  PilO; putative type IV pilus biosynthesis protein  28.26 
 
 		 421 aa  53.5  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.938925  normal  0.0381503 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59270  type IV b pilus protein  23.08 
 
 		 441 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00533868  hitchhiker  0.00000189781 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5450  hypothetical protein  24.01 
 
 		 429 aa  50.8  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.752604  normal  0.0236455 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>