24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5241 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007949  Bpro_5241  hypothetical protein  100 
 
 		 430 aa  880    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5450  hypothetical protein  84.88 
 
 		 429 aa  738    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.752604  normal  0.0236455 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5910  PilO; putative type IV pilus biosynthesis protein  27.52 
 
 		 421 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.938925  normal  0.0381503 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0770  pilO family protein  26.39 
 
 		 429 aa  114  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.15746  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1609  putative PilO  25.72 
 
 		 432 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.289822  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0656  putative type IV pilus biosynthesis protein  25.72 
 
 		 432 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1980  putative PilO  25.72 
 
 		 432 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.778405  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2256  putative type IV pilus biogenesis protein  25.72 
 
 		 432 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2172  putative type IV pilus biogenesis protein  25.72 
 
 		 432 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273576  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0659  putative PilO  25.72 
 
 		 432 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.591304  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4472  type IV b pilus protein  25.92 
 
 		 441 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5879  pilO; putative type IV pilus biosynthesis protein  24.34 
 
 		 438 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.87974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5662  PilO; putative type IV pilus biosynthesis protein  23.35 
 
 		 438 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125237  normal  0.028275 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59270  type IV b pilus protein  25.06 
 
 		 441 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00533868  hitchhiker  0.00000189781 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1516  hypothetical protein  25.52 
 
 		 452 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.314645  normal  0.315596 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0061  putative type IV secretion system protein PilO2  20.38 
 
 		 444 aa  60.8  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1535  hypothetical protein  23.94 
 
 		 417 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.197533  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5200  putative type IV pilus biosynthesis protein  23.94 
 
 		 417 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0116  PilO protein  23.23 
 
 		 431 aa  57.4  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0015  type IV pilus biogenesis protein PilO2  20.53 
 
 		 511 aa  51.6  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3733  pilin accessory protein PilO  22.51 
 
 		 445 aa  49.3  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5435  putative component of type II secretion apparatus  25.47 
 
 		 419 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0626  hypothetical protein  21.9 
 
 		 437 aa  44.7  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6154  hypothetical protein  23.34 
 
 		 409 aa  43.5  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>