12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4627 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_4627  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  259  6.999999999999999e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.103577 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4891  hypothetical protein  87.6 
 
 		 129 aa  225  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.735125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4713  hypothetical protein  85.94 
 
 		 129 aa  220  4e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.18727 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4835  hypothetical protein  85.16 
 
 		 129 aa  218  3e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.583696  normal  0.513656 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0599  hypothetical protein  50 
 
 		 133 aa  122  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.222423  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3339  hypothetical protein  38.35 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15110  hypothetical protein  37.31 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.225372  hitchhiker  0.000572412 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1329  hypothetical protein  36.64 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1854  hypothetical protein  34.4 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0163081  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2061  putative lipoprotein  35.66 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0141524  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3336  hypothetical protein  35.38 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.566862  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2843  hypothetical protein  28.46 
 
 		 127 aa  41.2  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00037044  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>