11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4891 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4891  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  253  8e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.735125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4713  hypothetical protein  95.35 
 
 		 129 aa  244  3e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.18727 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4835  hypothetical protein  94.57 
 
 		 129 aa  243  8e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.583696  normal  0.513656 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4627  hypothetical protein  87.6 
 
 		 129 aa  225  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.103577 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0599  hypothetical protein  50.77 
 
 		 133 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.222423  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3339  hypothetical protein  41.04 
 
 		 135 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15110  hypothetical protein  38.35 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.225372  hitchhiker  0.000572412 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1854  hypothetical protein  34.71 
 
 		 129 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0163081  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1329  hypothetical protein  36.92 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2061  putative lipoprotein  36.22 
 
 		 152 aa  43.9  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0141524  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3336  hypothetical protein  32.56 
 
 		 150 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.566862  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>