10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1854 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1854  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  265  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0163081  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3339  hypothetical protein  50 
 
 		 135 aa  105  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0599  hypothetical protein  41.27 
 
 		 133 aa  84  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.222423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4627  hypothetical protein  37.3 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.103577 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4835  hypothetical protein  38.58 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.583696  normal  0.513656 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15110  hypothetical protein  35.43 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.225372  hitchhiker  0.000572412 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4891  hypothetical protein  38.58 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.735125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4713  hypothetical protein  38.58 
 
 		 129 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.18727 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1329  hypothetical protein  33.86 
 
 		 122 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3336  hypothetical protein  31.97 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.566862  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>