14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_15110 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_15110  hypothetical protein  100 
 
 
129 aa  250  6e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.225372  hitchhiker  0.000572412 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1329  hypothetical protein  96.72 
 
 
122 aa  228  3e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4627  hypothetical protein  37.31 
 
 
129 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.103577 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4891  hypothetical protein  38.35 
 
 
129 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.735125  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4835  hypothetical protein  37.59 
 
 
129 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.583696  normal  0.513656 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0599  hypothetical protein  29.55 
 
 
133 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.222423  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4713  hypothetical protein  37.59 
 
 
129 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.18727 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1854  hypothetical protein  35.43 
 
 
129 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0163081  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3339  hypothetical protein  36.84 
 
 
135 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5305  hypothetical protein  33.85 
 
 
125 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0658757 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0695  hypothetical protein  30.83 
 
 
125 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.546911  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3385  hypothetical protein  33.85 
 
 
125 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.734008  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4982  hypothetical protein  33.85 
 
 
125 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.315016  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4925  hypothetical protein  32.58 
 
 
125 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.855297  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>