14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0599 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0599  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  275  1e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.222423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4627  hypothetical protein  50 
 
 		 129 aa  122  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.103577 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4713  hypothetical protein  50.77 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.18727 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4891  hypothetical protein  50.77 
 
 		 129 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.735125  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4835  hypothetical protein  50 
 
 		 129 aa  114  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.583696  normal  0.513656 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1854  hypothetical protein  41.13 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0163081  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3339  hypothetical protein  33.58 
 
 		 135 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1329  hypothetical protein  30.4 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15110  hypothetical protein  29.55 
 
 		 129 aa  53.5  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.225372  hitchhiker  0.000572412 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3336  hypothetical protein  33.33 
 
 		 150 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.566862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0686  putative lipoprotein  30.94 
 
 		 156 aa  43.9  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2061  putative lipoprotein  29.32 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0141524  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3337  hypothetical protein  33.09 
 
 		 131 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2048  hypothetical protein  30.88 
 
 		 136 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>