12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2048 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2048  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  276  6e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3337  hypothetical protein  40.94 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2843  hypothetical protein  35.38 
 
 		 127 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00037044  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3317  hypothetical protein  35.38 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2413  hypothetical protein  39.13 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3710  hypothetical protein  36.64 
 
 		 128 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3001  hypothetical protein  36.23 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.962421  normal  0.367237 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22820  hypothetical protein  36.51 
 
 		 123 aa  62.8  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3178  hypothetical protein  39.55 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.273793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05630  hypothetical protein  32.81 
 
 		 144 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0534  hypothetical protein  33.33 
 
 		 138 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0599  hypothetical protein  30.88 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.222423  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>