12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3710 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3710  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  253  7e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3001  hypothetical protein  48.84 
 
 		 129 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.962421  normal  0.367237 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2413  hypothetical protein  46.51 
 
 		 129 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3317  hypothetical protein  39.06 
 
 		 128 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2843  hypothetical protein  40 
 
 		 127 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00037044  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3337  hypothetical protein  38.1 
 
 		 131 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22820  hypothetical protein  41.86 
 
 		 123 aa  74.7  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2048  hypothetical protein  36.43 
 
 		 136 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3178  hypothetical protein  35.34 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.273793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05630  hypothetical protein  34.48 
 
 		 144 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0534  hypothetical protein  34.48 
 
 		 138 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3336  hypothetical protein  33.86 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.566862  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>