14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2843 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2843  hypothetical protein  100 
 
 		 127 aa  253  6e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00037044  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3337  hypothetical protein  50.81 
 
 		 131 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3178  hypothetical protein  51.67 
 
 		 132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.273793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3317  hypothetical protein  46.09 
 
 		 128 aa  103  8e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22820  hypothetical protein  45.16 
 
 		 123 aa  88.6  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3710  hypothetical protein  37.69 
 
 		 128 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2048  hypothetical protein  37.4 
 
 		 136 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2413  hypothetical protein  36.43 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3001  hypothetical protein  35.94 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.962421  normal  0.367237 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05630  hypothetical protein  38.28 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0534  hypothetical protein  38.28 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2688  hypothetical protein  32 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.354388  normal  0.785199 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4627  hypothetical protein  29.85 
 
 		 129 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.103577 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4835  hypothetical protein  31.58 
 
 		 129 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.583696  normal  0.513656 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>