13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3337 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3337  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  261  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3178  hypothetical protein  65.15 
 
 		 132 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.273793  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2843  hypothetical protein  50.81 
 
 		 127 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00037044  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3317  hypothetical protein  37.7 
 
 		 128 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2048  hypothetical protein  40.94 
 
 		 136 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22820  hypothetical protein  43.2 
 
 		 123 aa  71.6  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05630  hypothetical protein  39.73 
 
 		 144 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0534  hypothetical protein  39.26 
 
 		 138 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3001  hypothetical protein  34.85 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.962421  normal  0.367237 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3710  hypothetical protein  33.07 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2413  hypothetical protein  36.29 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2688  hypothetical protein  27.41 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.354388  normal  0.785199 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0599  hypothetical protein  33.09 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.222423  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>