10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2688 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2688  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  280  6.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.354388  normal  0.785199 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3337  hypothetical protein  30.15 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3178  hypothetical protein  27.2 
 
 		 132 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.273793  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22820  hypothetical protein  35.04 
 
 		 123 aa  47.8  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3317  hypothetical protein  28.78 
 
 		 128 aa  47  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2843  hypothetical protein  32.54 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00037044  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3001  hypothetical protein  26.28 
 
 		 129 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.962421  normal  0.367237 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3218  hypothetical protein  30.93 
 
 		 493 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0359272 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2413  hypothetical protein  30.23 
 
 		 129 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2048  hypothetical protein  31.01 
 
 		 136 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>