13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc3218 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3218  hypothetical protein  100 
 
 		 493 aa  1013    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0359272 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5510  hypothetical protein  65.62 
 
 		 451 aa  624  1e-178  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5206  hypothetical protein  66.82 
 
 		 446 aa  626  1e-178  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000638061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3369  hypothetical protein  63.23 
 
 		 492 aa  625  1e-178  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5207  hypothetical protein  66.15 
 
 		 446 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00402588  normal  0.851631 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3368  hypothetical protein  65.48 
 
 		 447 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5508  hypothetical protein  66.51 
 
 		 445 aa  570  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1688  hypothetical protein  32.07 
 
 		 525 aa  72.8  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.3838 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3649  hypothetical protein  31.45 
 
 		 499 aa  70.9  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2252  hypothetical protein  30.17 
 
 		 531 aa  69.7  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.632916  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1928  hypothetical protein  30.58 
 
 		 531 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.163722  normal  0.0157636 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3326  hypothetical protein  31.73 
 
 		 532 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3325  hypothetical protein  32.23 
 
 		 526 aa  65.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>