13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3326 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_2252  hypothetical protein  66.79 
 
 		 531 aa  646    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.632916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3649  hypothetical protein  89.18 
 
 		 499 aa  824    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1928  hypothetical protein  66.98 
 
 		 531 aa  650    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.163722  normal  0.0157636 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3325  hypothetical protein  91.22 
 
 		 526 aa  870    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3326  hypothetical protein  100 
 
 		 532 aa  1097    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1688  hypothetical protein  68.07 
 
 		 525 aa  627  1e-178  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.3838 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3218  hypothetical protein  32.67 
 
 		 493 aa  100  8e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0359272 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5508  hypothetical protein  25.42 
 
 		 445 aa  97.8  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5510  hypothetical protein  31.33 
 
 		 451 aa  95.5  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3368  hypothetical protein  30.58 
 
 		 447 aa  92.4  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5206  hypothetical protein  30.99 
 
 		 446 aa  91.7  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000638061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5207  hypothetical protein  30.36 
 
 		 446 aa  89  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00402588  normal  0.851631 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3369  hypothetical protein  29.96 
 
 		 492 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>