13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3368 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_5206  hypothetical protein  91.28 
 
 		 446 aa  850    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000638061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5207  hypothetical protein  83.67 
 
 		 446 aa  768    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00402588  normal  0.851631 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3368  hypothetical protein  100 
 
 		 447 aa  919    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3369  hypothetical protein  83.45 
 
 		 492 aa  748    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3218  hypothetical protein  65.7 
 
 		 493 aa  598  1e-170  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0359272 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5510  hypothetical protein  63.98 
 
 		 451 aa  597  1e-170  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5508  hypothetical protein  63.03 
 
 		 445 aa  548  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1928  hypothetical protein  29.39 
 
 		 531 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.163722  normal  0.0157636 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1688  hypothetical protein  30.83 
 
 		 525 aa  74.3  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.3838 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2252  hypothetical protein  28.98 
 
 		 531 aa  73.9  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.632916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3649  hypothetical protein  27.53 
 
 		 499 aa  67.8  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3326  hypothetical protein  28.29 
 
 		 532 aa  64.7  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3325  hypothetical protein  29.58 
 
 		 526 aa  63.5  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>