13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5207 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_5206  hypothetical protein  87.22 
 
 		 446 aa  801    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000638061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5207  hypothetical protein  100 
 
 		 446 aa  918    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00402588  normal  0.851631 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3368  hypothetical protein  83.67 
 
 		 447 aa  756    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3369  hypothetical protein  95.96 
 
 		 492 aa  862    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3218  hypothetical protein  65.4 
 
 		 493 aa  596  1e-169  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0359272 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5510  hypothetical protein  63.23 
 
 		 451 aa  580  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5508  hypothetical protein  61.78 
 
 		 445 aa  530  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1928  hypothetical protein  28.98 
 
 		 531 aa  71.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.163722  normal  0.0157636 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2252  hypothetical protein  28.57 
 
 		 531 aa  70.5  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.632916  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1688  hypothetical protein  30.42 
 
 		 525 aa  70.1  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.3838 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3649  hypothetical protein  27.53 
 
 		 499 aa  65.1  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3325  hypothetical protein  31.9 
 
 		 526 aa  63.9  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3326  hypothetical protein  33.62 
 
 		 532 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>