25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2061 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2061  putative lipoprotein  100 
 
 		 152 aa  308  2e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0141524  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0686  putative lipoprotein  47.06 
 
 		 156 aa  137  7.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3200  hypothetical protein  37.31 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.381275  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1174  hypothetical protein  40.59 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.240038 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0531  hypothetical protein  35.38 
 
 		 155 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.439084  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1009  hypothetical protein  35.38 
 
 		 155 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000222538  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4627  hypothetical protein  35.66 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.103577 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4117  hypothetical protein  31.06 
 
 		 155 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000467794  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0969  hypothetical protein  33.85 
 
 		 129 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0219351  normal  0.234882 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2389  hypothetical protein  35.66 
 
 		 129 aa  44.3  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4891  hypothetical protein  36.22 
 
 		 129 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.735125  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4835  hypothetical protein  36.22 
 
 		 129 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.583696  normal  0.513656 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0675  hypothetical protein  32.71 
 
 		 105 aa  43.9  0.0009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.383482  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4713  hypothetical protein  37.01 
 
 		 129 aa  43.9  0.0009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.18727 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2708  hypothetical protein  34.85 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0695  hypothetical protein  32.82 
 
 		 125 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.546911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0599  hypothetical protein  29.32 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.222423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3038  hypothetical protein  33.55 
 
 		 158 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000389489  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0478  hypothetical protein  33.55 
 
 		 158 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.492796  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4247  hypothetical protein  33.59 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4135  putative transmembrane protein  33.59 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.347049 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4406  hypothetical protein  32.81 
 
 		 125 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.102877 
 
 
-
 
NC_003296  RS05317  hypothetical protein  33.61 
 
 		 155 aa  40.8  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.675119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4925  hypothetical protein  32.81 
 
 		 125 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.855297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2894  hypothetical protein  33.77 
 
 		 161 aa  40  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243171 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>