32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1623 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_1623  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  273  4e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0612  putative sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  63.81 
 
 		 107 aa  153  7e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0565  hypothetical protein  64.76 
 
 		 107 aa  153  7e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0689  hypothetical protein  72.38 
 
 		 106 aa  151  2e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0583  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  58.1 
 
 		 109 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.12276 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0518  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  58.49 
 
 		 110 aa  133  7.000000000000001e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1763  hypothetical protein  59.62 
 
 		 106 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0386  phage integrase family site specific recombinase  27.35 
 
 		 400 aa  58.9  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4148  SSU ribosomal protein S30P / sigma 54 modulation protein  35.37 
 
 		 108 aa  52.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03665  ribosome-associated protein Y  36.14 
 
 		 95 aa  50.8  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0750  sigma54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  31.91 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0707  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  33.33 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.17625  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0972  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  31.91 
 
 		 111 aa  47.8  0.00005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00147055  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0497  sigma-54 modulation protein  36.14 
 
 		 95 aa  47  0.00009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.275154  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00065  putative sigma(54) modulation protein  31.65 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0371  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  31.91 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.19652 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002402  ribosome hibernation protein YhbH  33.73 
 
 		 95 aa  45.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0841  ribosomal subunit interface protein  28.42 
 
 		 115 aa  44.7  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.687272 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1699  putative sigma-54 modulation protein  26.26 
 
 		 99 aa  43.5  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0999  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  27.37 
 
 		 197 aa  43.5  0.0008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0736054  normal  0.80204 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03194  ribosomal subunit interface protein  30.85 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0471  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  26.51 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0569  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  30.11 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1935  putative sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  26.25 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3255  putative sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  30.38 
 
 		 125 aa  41.6  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0985962 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1284  SSU ribosomal protein S30P / sigma 54 modulation protein  30.85 
 
 		 181 aa  42  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000434521 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2231  sigma 54 modulation protein / SSU ribosomal protein S30P  29.79 
 
 		 113 aa  42  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2756  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  23.91 
 
 		 207 aa  41.6  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144256  normal  0.0289785 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2716  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  34.57 
 
 		 102 aa  41.6  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0403  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  26.51 
 
 		 109 aa  40.8  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1886  ribosomal subunit interface protein  29.47 
 
 		 181 aa  40  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.618476  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0905  putative sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  24 
 
 		 195 aa  40  0.01  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.489949  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>