More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3373 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3373  PhoH family protein  100 
 
 		 446 aa  911    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.349535  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2961  PhoH family protein  56.33 
 
 		 442 aa  486  1e-136  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00132937  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2279  phoH-related protein  55.46 
 
 		 451 aa  477  1e-133  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.639212 
 
 
-
 
NC_002950  PG1323  PhoH family protein  54 
 
 		 444 aa  446  1.0000000000000001e-124  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2447  PhoH family protein  52.6 
 
 		 442 aa  429  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.115966  normal  0.868134 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1351  PhoH family protein  50.97 
 
 		 451 aa  422  1e-117  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00120306  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2311  PhoH family protein  45.87 
 
 		 453 aa  372  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.805307  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2315  PhoH family protein  46.86 
 
 		 439 aa  366  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.296996  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2239  PhoH family protein  47.01 
 
 		 441 aa  362  7.0000000000000005e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.198011 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1866  phoH family protein  47.22 
 
 		 440 aa  359  5e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.086625  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2521  nucleotide binding protein, PINc  46.99 
 
 		 442 aa  359  5e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.530709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2290  PhoH family protein  45.58 
 
 		 440 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1851  PhoH family ATPase  46.88 
 
 		 438 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252576  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1577  PhoH-like protein  46.43 
 
 		 440 aa  356  5e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0911953  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1933  PhoH family protein  45.13 
 
 		 440 aa  355  7.999999999999999e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2374  PhoH family protein  45.98 
 
 		 440 aa  354  2e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.833123  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2286  PhoH family protein  45.76 
 
 		 440 aa  353  4e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2494  PhoH family protein  45.49 
 
 		 438 aa  352  7e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415647  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1302  PhoH-like protein  46.21 
 
 		 439 aa  349  7e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000664986  normal  0.0143296 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0609  PhoH family protein  43.24 
 
 		 440 aa  339  5e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.25357  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2653  PhoH family protein  41.96 
 
 		 442 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.294096  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10930  PhoH family protein  41.44 
 
 		 439 aa  311  2e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1494  nucleotide binding protein, PINc  41.97 
 
 		 463 aa  308  1.0000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3966  PhoH family protein  41.24 
 
 		 442 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3998  PhoH family protein  41.24 
 
 		 442 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.546265  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3696  PhoH family protein  41.24 
 
 		 442 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3711  PhoH family protein  41.24 
 
 		 442 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.512229  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1186  PhoH family protein  41.24 
 
 		 442 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.454967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4054  PhoH family protein  41.24 
 
 		 442 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4070  PhoH family protein  41.07 
 
 		 442 aa  305  8.000000000000001e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00102862  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0148  PhoH family protein  40.89 
 
 		 428 aa  305  9.000000000000001e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000131616  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3863  PhoH family protein  41.02 
 
 		 442 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0022  PhoH family protein  40.58 
 
 		 442 aa  303  3.0000000000000004e-81  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3777  PhoH family protein  41.02 
 
 		 442 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.633139  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12201  hypothetical protein  41.2 
 
 		 463 aa  304  3.0000000000000004e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1848  PhoH family protein  41.32 
 
 		 453 aa  301  2e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4161  PhoH family protein  40.85 
 
 		 437 aa  299  7e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0831  PhoH family protein  40.9 
 
 		 412 aa  299  8e-80  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1543  nucleotide binding protein, PINc  41.47 
 
 		 462 aa  297  2e-79  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.107982  normal  0.828891 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3602  PhoH family protein  41.45 
 
 		 441 aa  296  7e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000255341  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1316  hypothetical protein  39.45 
 
 		 572 aa  292  7e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0440  PhoH family protein  40.77 
 
 		 418 aa  292  1e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0425  PhoH family protein  40.55 
 
 		 418 aa  291  2e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0479  PhoH family protein  39.74 
 
 		 410 aa  291  2e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0428  PhoH family protein  38.3 
 
 		 548 aa  290  5.0000000000000004e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0593193  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1252  PhoH family protein  38.14 
 
 		 575 aa  289  7e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00804597  normal  0.72873 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1191  PhoH family protein  38.14 
 
 		 575 aa  289  9e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.171726  normal  0.0177982 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1222  PhoH-like protein  38.79 
 
 		 475 aa  288  2e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.408575 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1970  PhoH-like protein  39.09 
 
 		 564 aa  286  4e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.368565  normal  0.217357 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2582  PhoH family protein  38.24 
 
 		 492 aa  286  5e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1728  nucleotide binding protein  38.72 
 
 		 465 aa  286  5.999999999999999e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0561726  normal  0.608115 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1469  PhoH family protein  38.7 
 
 		 469 aa  285  2.0000000000000002e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1865  PhoH family protein  38.19 
 
 		 600 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1185  PhoH family protein  38.7 
 
 		 469 aa  285  2.0000000000000002e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.940531 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0099  PhoH family protein  40.16 
 
 		 512 aa  283  3.0000000000000004e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.494499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1889  PhoH family protein  38.19 
 
 		 600 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.835175  hitchhiker  0.000000118582 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2309  PhoH-like protein  39.1 
 
 		 465 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00801738 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1210  PhoH-like protein  38.77 
 
 		 473 aa  283  5.000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1795  PhoH family protein  38.81 
 
 		 616 aa  281  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0220004 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6214  PhoH-like protein  37.97 
 
 		 600 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1408  PhoH family protein  37.9 
 
 		 601 aa  280  3e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.545496  normal  0.312062 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2392  putative ATPase, PhoH-like protein  38.12 
 
 		 564 aa  279  8e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0563545 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0920  PhoH family protein  38.59 
 
 		 606 aa  279  9e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.115039  normal  0.244887 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5166  PhoH-like protein  37.47 
 
 		 600 aa  278  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1775  PhoH family protein  37.71 
 
 		 606 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1997  PhoH-like protein  37.45 
 
 		 567 aa  278  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1803  PhoH family protein  37.71 
 
 		 606 aa  278  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0663  PhoH family protein  38.78 
 
 		 469 aa  277  3e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.860719  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0010  PhoH family protein  38.2 
 
 		 544 aa  277  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1159  PhoH family protein  38.2 
 
 		 544 aa  277  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.613186  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1886  PhoH family protein  38.2 
 
 		 544 aa  277  3e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.44962  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2282  PhoH family protein  38.2 
 
 		 544 aa  277  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.293655  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2407  PhoH family protein  38.2 
 
 		 628 aa  276  5e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0398735  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1396  PhoH family protein  38.2 
 
 		 597 aa  276  7e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.631064  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2243  PhoH family protein  38.2 
 
 		 597 aa  276  7e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2187  PhoH family protein  38.27 
 
 		 631 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2235  PhoH family protein  37.42 
 
 		 561 aa  274  2.0000000000000002e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0299193  hitchhiker  0.000000485186 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2029  PhoH family protein  37.55 
 
 		 573 aa  274  2.0000000000000002e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.877213 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1537  PhoH-like ATPase  37.42 
 
 		 562 aa  271  2e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.615224 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1554  PhoH-like protein  38.92 
 
 		 469 aa  269  7e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000065778  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2186  PhoH-like protein  37.08 
 
 		 562 aa  269  7e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.985404 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1946  PhoH-like protein  37.2 
 
 		 483 aa  269  8e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00130  PhoH family protein  38.54 
 
 		 465 aa  269  8.999999999999999e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.06025  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1234  PhoH family protein  37.08 
 
 		 494 aa  264  3e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0185488 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3210  PhoH family protein  37.47 
 
 		 587 aa  263  3e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2563  PhoH family protein  37.47 
 
 		 587 aa  263  4e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.388197  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5223  PhoH family protein  38.35 
 
 		 605 aa  263  4.999999999999999e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0963  PhoH-like protein  38.66 
 
 		 464 aa  263  6e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0413  PhoH family protein  37.95 
 
 		 472 aa  263  6.999999999999999e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.205876  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0283  PhoH-related protein  38.58 
 
 		 434 aa  261  2e-68  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1508  PhoH family protein  38.92 
 
 		 466 aa  261  2e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.109703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0987  PhoH family protein  37.5 
 
 		 575 aa  261  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.740963 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1908  PhoH-like protein  37.11 
 
 		 605 aa  260  3e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0898  PhoH family protein  38.96 
 
 		 464 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0886799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4558  PhoH family protein  38.49 
 
 		 464 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.570751 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1066  PhoH-like protein  38.71 
 
 		 464 aa  259  9e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.128734  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1291  PhoH family protein  38.44 
 
 		 464 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.777539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4434  PhoH family protein  38.44 
 
 		 464 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.879472 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11240  PhoH-like protein  36.05 
 
 		 464 aa  255  1.0000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.653807  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2200  PhoH family protein  38.15 
 
 		 444 aa  255  1.0000000000000001e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.033076  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>