More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2961 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2961  PhoH family protein  100 
 
 
442 aa  911    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00132937  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3373  PhoH family protein  56.33 
 
 
446 aa  471  1.0000000000000001e-131  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.349535  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2279  phoH-related protein  54.42 
 
 
451 aa  463  1e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.639212 
 
 
-
 
NC_002950  PG1323  PhoH family protein  50.9 
 
 
444 aa  436  1e-121  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1351  PhoH family protein  51.22 
 
 
451 aa  429  1e-119  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00120306  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2447  PhoH family protein  49.89 
 
 
442 aa  422  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.115966  normal  0.868134 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2311  PhoH family protein  46.09 
 
 
453 aa  373  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.805307  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1933  PhoH family protein  44.54 
 
 
440 aa  365  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2290  PhoH family protein  44.32 
 
 
440 aa  365  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1866  phoH family protein  44.52 
 
 
440 aa  363  3e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.086625  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1302  PhoH-like protein  44.74 
 
 
439 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000664986  normal  0.0143296 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2494  PhoH family protein  44.64 
 
 
438 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415647  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2315  PhoH family protein  45.29 
 
 
439 aa  353  4e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.296996  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1851  PhoH family ATPase  45.45 
 
 
438 aa  352  1e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252576  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10930  PhoH family protein  43.39 
 
 
439 aa  340  2.9999999999999998e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2653  PhoH family protein  43.24 
 
 
442 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.294096  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0609  PhoH family protein  41.99 
 
 
440 aa  337  2.9999999999999997e-91  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.25357  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2374  PhoH family protein  43.5 
 
 
440 aa  334  2e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.833123  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2286  PhoH family protein  43.5 
 
 
440 aa  333  3e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3777  PhoH family protein  43.11 
 
 
442 aa  333  3e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.633139  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1577  PhoH-like protein  43.05 
 
 
440 aa  332  7.000000000000001e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0911953  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3998  PhoH family protein  42.89 
 
 
442 aa  332  9e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.546265  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3696  PhoH family protein  42.89 
 
 
442 aa  332  9e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3711  PhoH family protein  42.89 
 
 
442 aa  332  9e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.512229  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4054  PhoH family protein  42.89 
 
 
442 aa  332  9e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1186  PhoH family protein  42.89 
 
 
442 aa  332  9e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.454967  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3966  PhoH family protein  42.89 
 
 
442 aa  332  9e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0022  PhoH family protein  42.22 
 
 
442 aa  332  1e-89  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4070  PhoH family protein  42.89 
 
 
442 aa  332  1e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00102862  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3863  PhoH family protein  42.67 
 
 
442 aa  330  3e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2239  PhoH family protein  42.76 
 
 
441 aa  329  6e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.198011 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2521  nucleotide binding protein, PINc  42.7 
 
 
442 aa  328  1.0000000000000001e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.530709  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4161  PhoH family protein  42.51 
 
 
437 aa  325  7e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1543  nucleotide binding protein, PINc  42.46 
 
 
462 aa  325  1e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.107982  normal  0.828891 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1848  PhoH family protein  42.76 
 
 
453 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0440  PhoH family protein  44.29 
 
 
418 aa  318  1e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0148  PhoH family protein  41.52 
 
 
428 aa  318  1e-85  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000131616  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0425  PhoH family protein  44.06 
 
 
418 aa  317  3e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1494  nucleotide binding protein, PINc  41.24 
 
 
463 aa  313  2.9999999999999996e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0831  PhoH family protein  41.63 
 
 
412 aa  306  7e-82  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12201  hypothetical protein  40.38 
 
 
463 aa  301  2e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1316  hypothetical protein  38.81 
 
 
572 aa  295  1e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0479  PhoH family protein  41.04 
 
 
410 aa  294  2e-78  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1252  PhoH family protein  38.59 
 
 
575 aa  293  4e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00804597  normal  0.72873 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1191  PhoH family protein  38.59 
 
 
575 aa  293  6e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.171726  normal  0.0177982 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2309  PhoH-like protein  39.61 
 
 
465 aa  292  7e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00801738 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3602  PhoH family protein  42.29 
 
 
441 aa  291  1e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000255341  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2582  PhoH family protein  39.83 
 
 
492 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0920  PhoH family protein  38.49 
 
 
606 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.115039  normal  0.244887 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1408  PhoH family protein  38.49 
 
 
601 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.545496  normal  0.312062 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0663  PhoH family protein  37.53 
 
 
469 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.860719  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5166  PhoH-like protein  38.06 
 
 
600 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1795  PhoH family protein  37.23 
 
 
616 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0220004 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1728  nucleotide binding protein  38.78 
 
 
465 aa  283  6.000000000000001e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0561726  normal  0.608115 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1775  PhoH family protein  38.06 
 
 
606 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1889  PhoH family protein  37.69 
 
 
600 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.835175  hitchhiker  0.000000118582 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1865  PhoH family protein  37.69 
 
 
600 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1803  PhoH family protein  38.06 
 
 
606 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2187  PhoH family protein  37.39 
 
 
631 aa  281  2e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2392  putative ATPase, PhoH-like protein  37.23 
 
 
564 aa  281  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0563545 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1970  PhoH-like protein  36.71 
 
 
564 aa  280  3e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.368565  normal  0.217357 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1396  PhoH family protein  37.85 
 
 
597 aa  280  4e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.631064  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0010  PhoH family protein  37.85 
 
 
544 aa  280  4e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2282  PhoH family protein  37.85 
 
 
544 aa  280  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.293655  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1159  PhoH family protein  37.85 
 
 
544 aa  280  4e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.613186  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1886  PhoH family protein  37.85 
 
 
544 aa  280  4e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.44962  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2407  PhoH family protein  37.85 
 
 
628 aa  280  5e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0398735  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2243  PhoH family protein  37.85 
 
 
597 aa  280  5e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6214  PhoH-like protein  37.29 
 
 
600 aa  280  5e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5223  PhoH family protein  36.74 
 
 
605 aa  279  6e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1222  PhoH-like protein  38.43 
 
 
475 aa  278  1e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.408575 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1537  PhoH-like ATPase  37.23 
 
 
562 aa  278  1e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.615224 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2186  PhoH-like protein  36.97 
 
 
562 aa  277  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.985404 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2029  PhoH family protein  37.39 
 
 
573 aa  278  2e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.877213 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0428  PhoH family protein  36.6 
 
 
548 aa  277  3e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0593193  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2235  PhoH family protein  37.18 
 
 
561 aa  276  5e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0299193  hitchhiker  0.000000485186 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1997  PhoH-like protein  37.45 
 
 
567 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1210  PhoH-like protein  38.12 
 
 
473 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1908  PhoH-like protein  37.21 
 
 
605 aa  273  3e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3210  PhoH family protein  37.14 
 
 
587 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2563  PhoH family protein  37.14 
 
 
587 aa  273  5.000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.388197  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1234  PhoH family protein  37.42 
 
 
494 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0185488 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1185  PhoH family protein  35.82 
 
 
469 aa  269  7e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.940531 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1469  PhoH family protein  35.82 
 
 
469 aa  269  7e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0963  PhoH-like protein  37.72 
 
 
464 aa  268  1e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1554  PhoH-like protein  37.66 
 
 
469 aa  268  1e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000065778  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0099  PhoH family protein  36.58 
 
 
512 aa  268  2e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.494499  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0987  PhoH family protein  36.93 
 
 
575 aa  267  2.9999999999999995e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.740963 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1946  PhoH-like protein  36.99 
 
 
483 aa  265  1e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1919  PhoH family protein  37.58 
 
 
459 aa  265  1e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0452134  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1637  PhoH family protein  37.58 
 
 
459 aa  264  2e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.169922  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2481  PhoH family protein  37.83 
 
 
450 aa  264  3e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2200  PhoH family protein  37.58 
 
 
444 aa  261  2e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.033076  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1827  PhoH family protein  35.66 
 
 
595 aa  258  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298411  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4558  PhoH family protein  36.85 
 
 
464 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.570751 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0898  PhoH family protein  36.42 
 
 
464 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0886799  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0342  hypothetical protein  37.39 
 
 
450 aa  257  3e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11240  PhoH-like protein  36.98 
 
 
464 aa  256  5e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.653807  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13190  hypothetical protein  36.92 
 
 
463 aa  256  6e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0491409  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1246  PhoH-like protein  36.85 
 
 
464 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.115875  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>