More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2235 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1316  hypothetical protein  63.35 
 
 		 572 aa  706    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1252  PhoH family protein  63.54 
 
 		 575 aa  705    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00804597  normal  0.72873 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1408  PhoH family protein  69.98 
 
 		 601 aa  689    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.545496  normal  0.312062 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1396  PhoH family protein  70.19 
 
 		 597 aa  685    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.631064  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2243  PhoH family protein  70.4 
 
 		 597 aa  688    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1222  PhoH-like protein  65.68 
 
 		 475 aa  656    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.408575 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1537  PhoH-like ATPase  67.84 
 
 		 562 aa  777    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.615224 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0920  PhoH family protein  71.21 
 
 		 606 aa  692    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.115039  normal  0.244887 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1997  PhoH-like protein  63.87 
 
 		 567 aa  708    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1728  nucleotide binding protein  66.88 
 
 		 465 aa  651    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0561726  normal  0.608115 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2407  PhoH family protein  70.4 
 
 		 628 aa  688    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0398735  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1886  PhoH family protein  70.4 
 
 		 544 aa  688    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.44962  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5166  PhoH-like protein  70.4 
 
 		 600 aa  693    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2282  PhoH family protein  70.4 
 
 		 544 aa  688    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.293655  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2582  PhoH family protein  63.29 
 
 		 492 aa  649    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0010  PhoH family protein  70.4 
 
 		 544 aa  688    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1946  PhoH-like protein  67.32 
 
 		 483 aa  657    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5223  PhoH family protein  66.39 
 
 		 605 aa  781    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1827  PhoH family protein  75.46 
 
 		 595 aa  826    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298411  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0342  hypothetical protein  68.51 
 
 		 450 aa  651    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1908  PhoH-like protein  72.8 
 
 		 605 aa  872    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2309  PhoH-like protein  68.17 
 
 		 465 aa  664    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00801738 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2186  PhoH-like protein  87.94 
 
 		 562 aa  992    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.985404 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2392  putative ATPase, PhoH-like protein  63.12 
 
 		 564 aa  704    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0563545 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1970  PhoH-like protein  63.72 
 
 		 564 aa  711    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.368565  normal  0.217357 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0428  PhoH family protein  61.35 
 
 		 548 aa  674    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0593193  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1234  PhoH family protein  84.62 
 
 		 494 aa  824    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0185488 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1795  PhoH family protein  64.46 
 
 		 616 aa  704    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0220004 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1191  PhoH family protein  73.12 
 
 		 575 aa  701    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.171726  normal  0.0177982 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3210  PhoH family protein  83.37 
 
 		 587 aa  818    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1803  PhoH family protein  70.19 
 
 		 606 aa  692    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0987  PhoH family protein  71.75 
 
 		 575 aa  797    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.740963 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2235  PhoH family protein  100 
 
 		 561 aa  1155    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0299193  hitchhiker  0.000000485186 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2563  PhoH family protein  83.37 
 
 		 587 aa  817    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.388197  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1159  PhoH family protein  70.4 
 
 		 544 aa  688    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.613186  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2029  PhoH family protein  68.28 
 
 		 573 aa  778    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.877213 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1210  PhoH-like protein  60.68 
 
 		 473 aa  575  1.0000000000000001e-163  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0413  PhoH family protein  62.02 
 
 		 472 aa  570  1e-161  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.205876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1469  PhoH family protein  57.02 
 
 		 469 aa  567  1e-160  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1185  PhoH family protein  57.02 
 
 		 469 aa  567  1e-160  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.940531 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0663  PhoH family protein  58.69 
 
 		 469 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.860719  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0641  PhoH family protein  61.51 
 
 		 476 aa  556  1e-157  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0328663  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00130  PhoH family protein  60.21 
 
 		 465 aa  541  1e-153  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.06025  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2901  hypothetical protein  56.03 
 
 		 468 aa  542  1e-153  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2754  hypothetical protein  56.03 
 
 		 468 aa  541  9.999999999999999e-153  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1508  PhoH family protein  59.01 
 
 		 466 aa  530  1e-149  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.109703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1554  PhoH-like protein  55.79 
 
 		 469 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000065778  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0824  PhoH-like protein  58.77 
 
 		 474 aa  478  1e-133  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2200  PhoH family protein  54.23 
 
 		 444 aa  469  1.0000000000000001e-131  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.033076  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2481  PhoH family protein  52.6 
 
 		 450 aa  457  1e-127  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1110  PhoH-like protein  45.82 
 
 		 522 aa  398  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.103342  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2341  PhoH family protein  44.76 
 
 		 461 aa  358  9.999999999999999e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319227  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13190  hypothetical protein  41.43 
 
 		 463 aa  347  2e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0491409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1033  PhoH family protein  41.7 
 
 		 463 aa  347  3e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4558  PhoH family protein  41.49 
 
 		 464 aa  346  6e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.570751 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03677  hypothetical protein  41.87 
 
 		 458 aa  345  8e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0898  PhoH family protein  41.91 
 
 		 464 aa  345  2e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0886799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1189  hypothetical protein  41.21 
 
 		 463 aa  344  2e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.541896  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0963  PhoH-like protein  41.03 
 
 		 464 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2090  hypothetical protein  41.99 
 
 		 458 aa  343  5e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.113617  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1291  PhoH family protein  41.28 
 
 		 464 aa  343  5.999999999999999e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.777539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4434  PhoH family protein  41.28 
 
 		 464 aa  343  5.999999999999999e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.879472 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4518  PhoH family protein  41.4 
 
 		 478 aa  341  2e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0458  PhoH family protein  42.61 
 
 		 464 aa  341  2e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.774796 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4323  PhoH family protein  43.5 
 
 		 464 aa  341  2e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11240  PhoH-like protein  41.65 
 
 		 464 aa  340  2.9999999999999998e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.653807  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002391  PhoH family protein  41.21 
 
 		 458 aa  340  5e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1066  PhoH-like protein  40.94 
 
 		 464 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.128734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0537  PhoH-like protein  41.86 
 
 		 464 aa  333  6e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.874296  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1246  PhoH-like protein  40.3 
 
 		 464 aa  332  8e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.115875  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0576  PhoH family protein  42.09 
 
 		 464 aa  325  1e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0626  PhoH family protein  42.43 
 
 		 464 aa  325  1e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3454  PhoH family protein  42.09 
 
 		 464 aa  324  2e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0575  PhoH family protein  42.09 
 
 		 464 aa  324  2e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0576  PhoH family protein  42.09 
 
 		 464 aa  324  3e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0536  PhoH family protein  42.46 
 
 		 464 aa  323  4e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3915  PhoH family protein  42.46 
 
 		 464 aa  323  4e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3732  PhoH family protein  42.46 
 
 		 464 aa  323  4e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3789  PhoH family protein  42.46 
 
 		 464 aa  323  4e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3507  PhoH family protein  40.9 
 
 		 464 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3301  PhoH family protein  41.49 
 
 		 464 aa  318  2e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3703  PhoH family protein  40.99 
 
 		 464 aa  317  3e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3130  PhoH family protein  41.83 
 
 		 463 aa  317  3e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3829  PhoH-like protein  39.87 
 
 		 465 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0815291  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2494  PhoH family protein  38.23 
 
 		 438 aa  315  9.999999999999999e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415647  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2315  PhoH family protein  38.39 
 
 		 439 aa  312  9e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.296996  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1040  PhoH family protein  38.08 
 
 		 468 aa  309  6.999999999999999e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.942918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2290  PhoH family protein  38.92 
 
 		 440 aa  309  8e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1933  PhoH family protein  38.92 
 
 		 440 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1866  phoH family protein  38.51 
 
 		 440 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.086625  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2311  PhoH family protein  36.93 
 
 		 453 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.805307  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1851  PhoH family ATPase  37.63 
 
 		 438 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252576  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0022  PhoH family protein  37.5 
 
 		 442 aa  303  5.000000000000001e-81  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0609  PhoH family protein  38.22 
 
 		 440 aa  301  1e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.25357  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1543  nucleotide binding protein, PINc  41.13 
 
 		 462 aa  301  2e-80  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.107982  normal  0.828891 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1302  PhoH-like protein  38.54 
 
 		 439 aa  301  2e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000664986  normal  0.0143296 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10930  PhoH family protein  38.71 
 
 		 439 aa  301  3e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2521  nucleotide binding protein, PINc  36.34 
 
 		 442 aa  293  6e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.530709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2374  PhoH family protein  36.6 
 
 		 440 aa  291  3e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.833123  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2286  PhoH family protein  36.6 
 
 		 440 aa  290  4e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>