More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1191 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1889  PhoH family protein  81.3 
 
 
600 aa  806    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.835175  hitchhiker  0.000000118582 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1191  PhoH family protein  100 
 
 
575 aa  1181    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.171726  normal  0.0177982 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2282  PhoH family protein  82.47 
 
 
544 aa  805    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.293655  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1316  hypothetical protein  94.61 
 
 
572 aa  1102    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1827  PhoH family protein  60.57 
 
 
595 aa  659    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298411  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1886  PhoH family protein  82.47 
 
 
544 aa  805    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.44962  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1396  PhoH family protein  82.25 
 
 
597 aa  802    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.631064  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0010  PhoH family protein  82.47 
 
 
544 aa  805    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1795  PhoH family protein  67.79 
 
 
616 aa  820    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0220004 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1222  PhoH-like protein  69.89 
 
 
475 aa  683    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.408575 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5223  PhoH family protein  72.36 
 
 
605 aa  694    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1159  PhoH family protein  82.47 
 
 
544 aa  805    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.613186  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1997  PhoH-like protein  81.62 
 
 
567 aa  944    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1728  nucleotide binding protein  72.92 
 
 
465 aa  706    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0561726  normal  0.608115 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2029  PhoH family protein  65.92 
 
 
573 aa  754    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.877213 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2407  PhoH family protein  82.47 
 
 
628 aa  806    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0398735  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5166  PhoH-like protein  80.29 
 
 
600 aa  808    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2235  PhoH family protein  63.1 
 
 
561 aa  707    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0299193  hitchhiker  0.000000485186 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2243  PhoH family protein  82.47 
 
 
597 aa  805    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0428  PhoH family protein  82.37 
 
 
548 aa  807    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0593193  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2582  PhoH family protein  69.7 
 
 
492 aa  693    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1946  PhoH-like protein  73.16 
 
 
483 aa  714    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1537  PhoH-like ATPase  65.81 
 
 
562 aa  750    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.615224 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2187  PhoH family protein  82.68 
 
 
631 aa  806    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3210  PhoH family protein  72.25 
 
 
587 aa  687    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1408  PhoH family protein  81.3 
 
 
601 aa  808    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.545496  normal  0.312062 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2563  PhoH family protein  72.25 
 
 
587 aa  687    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.388197  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0342  hypothetical protein  68.72 
 
 
450 aa  639    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1908  PhoH-like protein  60.55 
 
 
605 aa  705    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2309  PhoH-like protein  71 
 
 
465 aa  701    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00801738 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2186  PhoH-like protein  62.5 
 
 
562 aa  701    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.985404 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1234  PhoH family protein  73.35 
 
 
494 aa  702    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0185488 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1252  PhoH family protein  98.09 
 
 
575 aa  1161    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00804597  normal  0.72873 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2392  putative ATPase, PhoH-like protein  73.15 
 
 
564 aa  810    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0563545 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1970  PhoH-like protein  82.32 
 
 
564 aa  958    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.368565  normal  0.217357 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6214  PhoH-like protein  81.09 
 
 
600 aa  803    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0987  PhoH family protein  62.11 
 
 
575 aa  672    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.740963 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0920  PhoH family protein  67.92 
 
 
606 aa  812    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.115039  normal  0.244887 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1803  PhoH family protein  79.47 
 
 
606 aa  806    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1865  PhoH family protein  81.3 
 
 
600 aa  806    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1775  PhoH family protein  81.09 
 
 
606 aa  805    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1469  PhoH family protein  61.24 
 
 
469 aa  597  1e-169  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1185  PhoH family protein  61.24 
 
 
469 aa  597  1e-169  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.940531 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1210  PhoH-like protein  63.4 
 
 
473 aa  593  1e-168  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0413  PhoH family protein  64.27 
 
 
472 aa  591  1e-167  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.205876  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0663  PhoH family protein  62.69 
 
 
469 aa  585  1e-166  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.860719  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0641  PhoH family protein  64.12 
 
 
476 aa  578  1e-164  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0328663  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2754  hypothetical protein  58.03 
 
 
468 aa  555  1e-157  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2901  hypothetical protein  57.6 
 
 
468 aa  554  1e-156  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1508  PhoH family protein  60.3 
 
 
466 aa  534  1e-150  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.109703  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00130  PhoH family protein  60.43 
 
 
465 aa  534  1e-150  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.06025  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1554  PhoH-like protein  57.2 
 
 
469 aa  532  1e-150  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000065778  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0824  PhoH-like protein  61.88 
 
 
474 aa  507  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2200  PhoH family protein  57.33 
 
 
444 aa  497  1e-139  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.033076  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2481  PhoH family protein  52.26 
 
 
450 aa  451  1e-125  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1110  PhoH-like protein  45.86 
 
 
522 aa  434  1e-120  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.103342  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2341  PhoH family protein  44.42 
 
 
461 aa  362  9e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319227  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2090  hypothetical protein  43.8 
 
 
458 aa  362  1e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.113617  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11240  PhoH-like protein  43.56 
 
 
464 aa  355  2e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.653807  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03677  hypothetical protein  42.74 
 
 
458 aa  352  8e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1033  PhoH family protein  43.01 
 
 
463 aa  350  3e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002391  PhoH family protein  42.74 
 
 
458 aa  350  6e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4558  PhoH family protein  41.33 
 
 
464 aa  342  1e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.570751 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0963  PhoH-like protein  42.16 
 
 
464 aa  341  2e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1189  hypothetical protein  41.67 
 
 
463 aa  341  2e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.541896  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13190  hypothetical protein  41.67 
 
 
463 aa  341  2e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0491409  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0898  PhoH family protein  42.09 
 
 
464 aa  342  2e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0886799  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1291  PhoH family protein  41.54 
 
 
464 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.777539  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4434  PhoH family protein  41.54 
 
 
464 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.879472 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1066  PhoH-like protein  42.18 
 
 
464 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.128734  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1246  PhoH-like protein  42.18 
 
 
464 aa  335  1e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.115875  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2315  PhoH family protein  40.3 
 
 
439 aa  330  4e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.296996  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4518  PhoH family protein  40.69 
 
 
478 aa  329  8e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1040  PhoH family protein  40.59 
 
 
468 aa  328  1.0000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.942918  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4323  PhoH family protein  40.96 
 
 
464 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0458  PhoH family protein  41.3 
 
 
464 aa  327  3e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.774796 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0022  PhoH family protein  39.4 
 
 
442 aa  325  1e-87  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2311  PhoH family protein  37.92 
 
 
453 aa  325  1e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.805307  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0537  PhoH-like protein  41.7 
 
 
464 aa  324  2e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.874296  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2494  PhoH family protein  38.71 
 
 
438 aa  325  2e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415647  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1577  PhoH-like protein  40.85 
 
 
440 aa  322  8e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0911953  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1866  phoH family protein  38.96 
 
 
440 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.086625  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2286  PhoH family protein  40.43 
 
 
440 aa  318  2e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2374  PhoH family protein  40.43 
 
 
440 aa  318  2e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.833123  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3915  PhoH family protein  41.33 
 
 
464 aa  317  3e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3789  PhoH family protein  41.33 
 
 
464 aa  317  3e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3732  PhoH family protein  41.33 
 
 
464 aa  317  3e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0536  PhoH family protein  41.33 
 
 
464 aa  317  3e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1302  PhoH-like protein  39.74 
 
 
439 aa  317  5e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000664986  normal  0.0143296 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0576  PhoH family protein  41.33 
 
 
464 aa  316  7e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0576  PhoH family protein  41.33 
 
 
464 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3454  PhoH family protein  41.33 
 
 
464 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0575  PhoH family protein  41.33 
 
 
464 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1851  PhoH family ATPase  40.95 
 
 
438 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252576  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1933  PhoH family protein  38.76 
 
 
440 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2239  PhoH family protein  39.32 
 
 
441 aa  313  4.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.198011 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3301  PhoH family protein  41.28 
 
 
464 aa  313  6.999999999999999e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2290  PhoH family protein  38.79 
 
 
440 aa  312  1e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2521  nucleotide binding protein, PINc  39.53 
 
 
442 aa  311  2e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.530709  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3696  PhoH family protein  40.42 
 
 
442 aa  310  5e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>