More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1537 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_2029  PhoH family protein  79.41 
 
 
573 aa  921    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.877213 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1316  hypothetical protein  66.96 
 
 
572 aa  755    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2563  PhoH family protein  75.8 
 
 
587 aa  753    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.388197  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0010  PhoH family protein  71.64 
 
 
544 aa  715    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1396  PhoH family protein  61.23 
 
 
597 aa  711    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.631064  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2282  PhoH family protein  71.64 
 
 
544 aa  715    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.293655  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1222  PhoH-like protein  66.04 
 
 
475 aa  667    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.408575 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1775  PhoH family protein  71.61 
 
 
606 aa  714    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1889  PhoH family protein  71.61 
 
 
600 aa  711    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.835175  hitchhiker  0.000000118582 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1537  PhoH-like ATPase  100 
 
 
562 aa  1148    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.615224 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1997  PhoH-like protein  66.1 
 
 
567 aa  750    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1728  nucleotide binding protein  70.34 
 
 
465 aa  689    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0561726  normal  0.608115 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2407  PhoH family protein  61.4 
 
 
628 aa  714    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0398735  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5166  PhoH-like protein  71.58 
 
 
600 aa  722    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1946  PhoH-like protein  68.31 
 
 
483 aa  689    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2243  PhoH family protein  61.4 
 
 
597 aa  714    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1252  PhoH family protein  66.49 
 
 
575 aa  751    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00804597  normal  0.72873 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1159  PhoH family protein  71.64 
 
 
544 aa  715    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.613186  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1908  PhoH-like protein  63.82 
 
 
605 aa  774    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2309  PhoH-like protein  68.37 
 
 
465 aa  671    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00801738 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2186  PhoH-like protein  69.1 
 
 
562 aa  796    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.985404 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2392  putative ATPase, PhoH-like protein  63.68 
 
 
564 aa  715    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0563545 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1970  PhoH-like protein  67.71 
 
 
564 aa  759    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.368565  normal  0.217357 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1408  PhoH family protein  71.78 
 
 
601 aa  718    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.545496  normal  0.312062 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0342  hypothetical protein  73.13 
 
 
450 aa  697    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3210  PhoH family protein  75.8 
 
 
587 aa  754    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6214  PhoH-like protein  71.4 
 
 
600 aa  707    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2582  PhoH family protein  67.73 
 
 
492 aa  674    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1191  PhoH family protein  66.61 
 
 
575 aa  756    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.171726  normal  0.0177982 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2235  PhoH family protein  67.59 
 
 
561 aa  785    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0299193  hitchhiker  0.000000485186 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0920  PhoH family protein  59.48 
 
 
606 aa  706    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.115039  normal  0.244887 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1234  PhoH family protein  75.48 
 
 
494 aa  746    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0185488 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1803  PhoH family protein  70.62 
 
 
606 aa  718    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1795  PhoH family protein  64.73 
 
 
616 aa  712    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0220004 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1865  PhoH family protein  71.61 
 
 
600 aa  711    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1886  PhoH family protein  71.64 
 
 
544 aa  715    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.44962  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0428  PhoH family protein  70.36 
 
 
548 aa  697    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0593193  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1827  PhoH family protein  64.21 
 
 
595 aa  725    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298411  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5223  PhoH family protein  73.84 
 
 
605 aa  731    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0987  PhoH family protein  65.34 
 
 
575 aa  721    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.740963 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1210  PhoH-like protein  62.95 
 
 
473 aa  602  1.0000000000000001e-171  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0413  PhoH family protein  62.98 
 
 
472 aa  592  1e-168  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.205876  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1185  PhoH family protein  58.82 
 
 
469 aa  585  1e-166  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.940531 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1469  PhoH family protein  58.82 
 
 
469 aa  585  1e-166  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0641  PhoH family protein  63.89 
 
 
476 aa  580  1e-164  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0328663  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0663  PhoH family protein  60.39 
 
 
469 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.860719  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2901  hypothetical protein  58.19 
 
 
468 aa  566  1e-160  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2754  hypothetical protein  58.41 
 
 
468 aa  567  1e-160  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1508  PhoH family protein  60.59 
 
 
466 aa  546  1e-154  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.109703  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00130  PhoH family protein  59.7 
 
 
465 aa  544  1e-153  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.06025  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1554  PhoH-like protein  54.68 
 
 
469 aa  523  1e-147  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000065778  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0824  PhoH-like protein  62.19 
 
 
474 aa  506  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2200  PhoH family protein  56.72 
 
 
444 aa  482  1e-135  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.033076  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2481  PhoH family protein  51.71 
 
 
450 aa  446  1.0000000000000001e-124  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1110  PhoH-like protein  44.49 
 
 
522 aa  400  9.999999999999999e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.103342  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2341  PhoH family protein  44.92 
 
 
461 aa  367  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319227  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1033  PhoH family protein  43.13 
 
 
463 aa  355  1e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4558  PhoH family protein  42.23 
 
 
464 aa  352  8e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.570751 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13190  hypothetical protein  42.64 
 
 
463 aa  352  1e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0491409  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1189  hypothetical protein  42.64 
 
 
463 aa  350  3e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.541896  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0963  PhoH-like protein  41.98 
 
 
464 aa  350  5e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0898  PhoH family protein  42.56 
 
 
464 aa  349  7e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0886799  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2090  hypothetical protein  43.44 
 
 
458 aa  349  8e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.113617  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11240  PhoH-like protein  42.95 
 
 
464 aa  348  1e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.653807  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1291  PhoH family protein  42.74 
 
 
464 aa  348  2e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.777539  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4434  PhoH family protein  42.74 
 
 
464 aa  348  2e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.879472 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1066  PhoH-like protein  40.88 
 
 
464 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.128734  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4518  PhoH family protein  41.97 
 
 
478 aa  337  2.9999999999999997e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03677  hypothetical protein  41.81 
 
 
458 aa  337  2.9999999999999997e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1246  PhoH-like protein  40.08 
 
 
464 aa  335  1e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.115875  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0537  PhoH-like protein  43.16 
 
 
464 aa  335  1e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.874296  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4323  PhoH family protein  42.95 
 
 
464 aa  334  2e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002391  PhoH family protein  41.81 
 
 
458 aa  333  5e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0536  PhoH family protein  43.43 
 
 
464 aa  332  8e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3732  PhoH family protein  43.43 
 
 
464 aa  332  8e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3915  PhoH family protein  43.43 
 
 
464 aa  332  8e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3789  PhoH family protein  43.43 
 
 
464 aa  332  8e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0458  PhoH family protein  42.41 
 
 
464 aa  332  1e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.774796 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0576  PhoH family protein  43.22 
 
 
464 aa  330  3e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0576  PhoH family protein  43.19 
 
 
464 aa  330  5.0000000000000004e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3454  PhoH family protein  43.22 
 
 
464 aa  330  5.0000000000000004e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0575  PhoH family protein  43.22 
 
 
464 aa  330  5.0000000000000004e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3130  PhoH family protein  43.01 
 
 
463 aa  325  1e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3301  PhoH family protein  42.95 
 
 
464 aa  325  2e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0626  PhoH family protein  42.86 
 
 
464 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2494  PhoH family protein  39.45 
 
 
438 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415647  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3507  PhoH family protein  41.1 
 
 
464 aa  318  2e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1866  phoH family protein  40.17 
 
 
440 aa  317  3e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.086625  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1040  PhoH family protein  40.08 
 
 
468 aa  317  3e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.942918  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2315  PhoH family protein  39.1 
 
 
439 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.296996  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3829  PhoH-like protein  40.6 
 
 
465 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0815291  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0022  PhoH family protein  38.32 
 
 
442 aa  312  9e-84  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3703  PhoH family protein  41.26 
 
 
464 aa  311  1e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2311  PhoH family protein  37.82 
 
 
453 aa  310  5.9999999999999995e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.805307  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1302  PhoH-like protein  39.96 
 
 
439 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000664986  normal  0.0143296 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2521  nucleotide binding protein, PINc  40.38 
 
 
442 aa  306  7e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.530709  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1851  PhoH family ATPase  40.43 
 
 
438 aa  306  9.000000000000001e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252576  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2290  PhoH family protein  38.72 
 
 
440 aa  301  2e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1933  PhoH family protein  38.3 
 
 
440 aa  300  6e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1543  nucleotide binding protein, PINc  41.42 
 
 
462 aa  299  7e-80  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.107982  normal  0.828891 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>