More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0479 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0479  PhoH family protein  100 
 
 
410 aa  837    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0831  PhoH family protein  62.86 
 
 
412 aa  542  1e-153  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0440  PhoH family protein  61.52 
 
 
418 aa  509  1e-143  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0425  PhoH family protein  61.76 
 
 
418 aa  510  1e-143  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0148  PhoH family protein  48.72 
 
 
428 aa  405  1.0000000000000001e-112  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000131616  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2311  PhoH family protein  46.7 
 
 
453 aa  387  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.805307  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1933  PhoH family protein  47.51 
 
 
440 aa  386  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1302  PhoH-like protein  46.49 
 
 
439 aa  385  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000664986  normal  0.0143296 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2290  PhoH family protein  47.51 
 
 
440 aa  388  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1866  phoH family protein  46.61 
 
 
440 aa  383  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.086625  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2239  PhoH family protein  46.85 
 
 
441 aa  378  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.198011 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2374  PhoH family protein  46.12 
 
 
440 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.833123  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2286  PhoH family protein  46.12 
 
 
440 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1577  PhoH-like protein  45.9 
 
 
440 aa  378  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0911953  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2315  PhoH family protein  46.28 
 
 
439 aa  375  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.296996  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1851  PhoH family ATPase  45.58 
 
 
438 aa  368  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252576  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2521  nucleotide binding protein, PINc  44.59 
 
 
442 aa  361  1e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.530709  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0022  PhoH family protein  45.07 
 
 
442 aa  361  2e-98  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10930  PhoH family protein  45.54 
 
 
439 aa  361  2e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2494  PhoH family protein  43.5 
 
 
438 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415647  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3998  PhoH family protein  45.98 
 
 
442 aa  351  1e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.546265  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1186  PhoH family protein  45.98 
 
 
442 aa  351  1e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.454967  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3696  PhoH family protein  45.98 
 
 
442 aa  351  1e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3711  PhoH family protein  45.98 
 
 
442 aa  351  1e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.512229  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3966  PhoH family protein  45.98 
 
 
442 aa  351  1e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4054  PhoH family protein  45.98 
 
 
442 aa  351  1e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4070  PhoH family protein  45.98 
 
 
442 aa  351  2e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00102862  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2653  PhoH family protein  46.17 
 
 
442 aa  349  5e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.294096  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3777  PhoH family protein  45.76 
 
 
442 aa  349  6e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.633139  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3863  PhoH family protein  45.76 
 
 
442 aa  348  7e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0609  PhoH family protein  46.5 
 
 
440 aa  348  8e-95  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.25357  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1848  PhoH family protein  45.96 
 
 
453 aa  347  2e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4161  PhoH family protein  45.6 
 
 
437 aa  345  1e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3602  PhoH family protein  44.14 
 
 
441 aa  338  8e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000255341  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1494  nucleotide binding protein, PINc  43.04 
 
 
463 aa  327  3e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12201  hypothetical protein  42.3 
 
 
463 aa  321  9.999999999999999e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1543  nucleotide binding protein, PINc  39.35 
 
 
462 aa  305  8.000000000000001e-82  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.107982  normal  0.828891 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1351  PhoH family protein  40.22 
 
 
451 aa  298  8e-80  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00120306  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2961  PhoH family protein  41.04 
 
 
442 aa  294  2e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00132937  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0099  PhoH family protein  38.46 
 
 
512 aa  293  3e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.494499  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3373  PhoH family protein  39.51 
 
 
446 aa  280  4e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.349535  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2279  phoH-related protein  40.9 
 
 
451 aa  279  7e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.639212 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1234  PhoH family protein  37.85 
 
 
494 aa  279  8e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0185488 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0428  PhoH family protein  38.96 
 
 
548 aa  278  1e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0593193  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0920  PhoH family protein  36.32 
 
 
606 aa  277  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.115039  normal  0.244887 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1919  PhoH family protein  40.56 
 
 
459 aa  276  4e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0452134  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5223  PhoH family protein  37.39 
 
 
605 aa  276  4e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1637  PhoH family protein  40.56 
 
 
459 aa  276  6e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.169922  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0283  PhoH-related protein  39.37 
 
 
434 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2563  PhoH family protein  37.18 
 
 
587 aa  275  2.0000000000000002e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.388197  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3210  PhoH family protein  37.18 
 
 
587 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1795  PhoH family protein  36.99 
 
 
616 aa  274  3e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0220004 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2582  PhoH family protein  37.98 
 
 
492 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2407  PhoH family protein  37.12 
 
 
628 aa  273  6e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0398735  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1396  PhoH family protein  37.12 
 
 
597 aa  272  7e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.631064  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0010  PhoH family protein  36.77 
 
 
544 aa  272  7e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2243  PhoH family protein  37.12 
 
 
597 aa  272  7e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1886  PhoH family protein  36.77 
 
 
544 aa  272  7e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.44962  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1159  PhoH family protein  36.77 
 
 
544 aa  272  7e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.613186  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2282  PhoH family protein  36.77 
 
 
544 aa  272  7e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.293655  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1408  PhoH family protein  35.56 
 
 
601 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.545496  normal  0.312062 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2187  PhoH family protein  36.91 
 
 
631 aa  271  1e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5166  PhoH-like protein  36.99 
 
 
600 aa  271  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1775  PhoH family protein  37.15 
 
 
606 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1803  PhoH family protein  37.15 
 
 
606 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2392  putative ATPase, PhoH-like protein  36.93 
 
 
564 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0563545 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6214  PhoH-like protein  36.99 
 
 
600 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1889  PhoH family protein  36.99 
 
 
600 aa  270  4e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.835175  hitchhiker  0.000000118582 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1304  PhoH-like protein  39.87 
 
 
457 aa  270  4e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1250  PhoH family protein  40.14 
 
 
437 aa  270  5e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.518978  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1865  PhoH family protein  36.99 
 
 
600 aa  270  5e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1252  PhoH family protein  37.5 
 
 
575 aa  269  7e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00804597  normal  0.72873 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1191  PhoH family protein  37.5 
 
 
575 aa  269  8e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.171726  normal  0.0177982 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1316  hypothetical protein  38.28 
 
 
572 aa  268  1e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1970  PhoH-like protein  37.5 
 
 
564 aa  268  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.368565  normal  0.217357 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1728  nucleotide binding protein  37.12 
 
 
465 aa  266  4e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0561726  normal  0.608115 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2309  PhoH-like protein  37.17 
 
 
465 aa  265  1e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00801738 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1508  PhoH family protein  37.77 
 
 
466 aa  263  4e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.109703  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1323  PhoH family protein  38.48 
 
 
444 aa  263  4.999999999999999e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1946  PhoH-like protein  36.73 
 
 
483 aa  263  4.999999999999999e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2447  PhoH family protein  40.05 
 
 
442 aa  262  8.999999999999999e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.115966  normal  0.868134 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2029  PhoH family protein  36.5 
 
 
573 aa  262  1e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.877213 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1066  PhoH-like protein  38.63 
 
 
464 aa  261  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.128734  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1997  PhoH-like protein  37.61 
 
 
567 aa  261  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0963  PhoH-like protein  37.02 
 
 
464 aa  261  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1222  PhoH-like protein  36.13 
 
 
475 aa  260  3e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.408575 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1246  PhoH-like protein  37.89 
 
 
464 aa  258  1e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.115875  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1537  PhoH-like ATPase  34.82 
 
 
562 aa  258  1e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.615224 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1291  PhoH family protein  36.04 
 
 
464 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.777539  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0987  PhoH family protein  35.84 
 
 
575 aa  258  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.740963 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4434  PhoH family protein  36.04 
 
 
464 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.879472 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1110  PhoH-like protein  34.96 
 
 
522 aa  258  2e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.103342  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11240  PhoH-like protein  35.48 
 
 
464 aa  258  2e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.653807  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4558  PhoH family protein  35.82 
 
 
464 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.570751 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00130  PhoH family protein  37.28 
 
 
465 aa  257  2e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.06025  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2754  hypothetical protein  36.5 
 
 
468 aa  256  3e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0898  PhoH family protein  35.82 
 
 
464 aa  256  5e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0886799  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2901  hypothetical protein  36.29 
 
 
468 aa  256  7e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13190  hypothetical protein  36.36 
 
 
463 aa  255  8e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0491409  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1033  PhoH family protein  35.48 
 
 
463 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>