More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4434 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1291  PhoH family protein  100 
 
 		 464 aa  955    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.777539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1189  hypothetical protein  84.05 
 
 		 463 aa  820    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.541896  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1246  PhoH-like protein  87.07 
 
 		 464 aa  850    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.115875  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4434  PhoH family protein  100 
 
 		 464 aa  955    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.879472 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1066  PhoH-like protein  87.5 
 
 		 464 aa  857    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.128734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0963  PhoH-like protein  87.5 
 
 		 464 aa  846    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1033  PhoH family protein  85.78 
 
 		 463 aa  824    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0898  PhoH family protein  98.06 
 
 		 464 aa  942    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0886799  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11240  PhoH-like protein  82.8 
 
 		 464 aa  804    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.653807  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4558  PhoH family protein  98.28 
 
 		 464 aa  943    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.570751 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13190  hypothetical protein  84.27 
 
 		 463 aa  823    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0491409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2341  PhoH family protein  67.83 
 
 		 461 aa  617  1e-176  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319227  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4518  PhoH family protein  51.95 
 
 		 478 aa  481  1e-134  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03677  hypothetical protein  49.45 
 
 		 458 aa  463  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2090  hypothetical protein  50.55 
 
 		 458 aa  462  1e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.113617  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002391  PhoH family protein  48.79 
 
 		 458 aa  456  1e-127  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0458  PhoH family protein  48.58 
 
 		 464 aa  432  1e-120  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.774796 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0537  PhoH-like protein  50.11 
 
 		 464 aa  429  1e-119  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.874296  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3829  PhoH-like protein  49.56 
 
 		 465 aa  430  1e-119  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0815291  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0576  PhoH family protein  50.86 
 
 		 464 aa  430  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3454  PhoH family protein  50.86 
 
 		 464 aa  429  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0575  PhoH family protein  50.86 
 
 		 464 aa  429  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3301  PhoH family protein  50.32 
 
 		 464 aa  427  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0576  PhoH family protein  50.44 
 
 		 464 aa  428  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3732  PhoH family protein  50.11 
 
 		 464 aa  425  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3789  PhoH family protein  50.11 
 
 		 464 aa  425  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4323  PhoH family protein  48.14 
 
 		 464 aa  426  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3915  PhoH family protein  50.11 
 
 		 464 aa  425  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0536  PhoH family protein  50.11 
 
 		 464 aa  425  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3130  PhoH family protein  49.34 
 
 		 463 aa  422  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0626  PhoH family protein  48.8 
 
 		 464 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3507  PhoH family protein  49.78 
 
 		 464 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3703  PhoH family protein  49.34 
 
 		 464 aa  414  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1040  PhoH family protein  45.42 
 
 		 468 aa  405  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.942918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03696  PhoH family protein  50.35 
 
 		 428 aa  398  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0663  PhoH family protein  43.76 
 
 		 469 aa  366  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.860719  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5223  PhoH family protein  42.74 
 
 		 605 aa  366  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0428  PhoH family protein  43.13 
 
 		 548 aa  364  2e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0593193  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2187  PhoH family protein  43.13 
 
 		 631 aa  359  6e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2200  PhoH family protein  42.54 
 
 		 444 aa  357  1.9999999999999998e-97  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.033076  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2309  PhoH-like protein  43.52 
 
 		 465 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00801738 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1234  PhoH family protein  42.07 
 
 		 494 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0185488 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1396  PhoH family protein  43.41 
 
 		 597 aa  355  1e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.631064  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1408  PhoH family protein  43.6 
 
 		 601 aa  355  1e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.545496  normal  0.312062 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2029  PhoH family protein  41.39 
 
 		 573 aa  354  2e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.877213 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1159  PhoH family protein  43.41 
 
 		 544 aa  354  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.613186  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2407  PhoH family protein  43.41 
 
 		 628 aa  354  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0398735  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2243  PhoH family protein  43.41 
 
 		 597 aa  354  2e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0010  PhoH family protein  43.41 
 
 		 544 aa  354  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2282  PhoH family protein  43.41 
 
 		 544 aa  354  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.293655  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1886  PhoH family protein  43.41 
 
 		 544 aa  354  2e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.44962  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1795  PhoH family protein  42.95 
 
 		 616 aa  351  1e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0220004 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1537  PhoH-like ATPase  42.74 
 
 		 562 aa  351  1e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.615224 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1222  PhoH-like protein  41.65 
 
 		 475 aa  350  2e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.408575 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1554  PhoH-like protein  43.01 
 
 		 469 aa  351  2e-95  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000065778  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1775  PhoH family protein  43.2 
 
 		 606 aa  351  2e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1803  PhoH family protein  43.2 
 
 		 606 aa  350  2e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0641  PhoH family protein  44.19 
 
 		 476 aa  350  3e-95  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0328663  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2392  putative ATPase, PhoH-like protein  42.49 
 
 		 564 aa  349  5e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0563545 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1185  PhoH family protein  42.19 
 
 		 469 aa  349  7e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.940531 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1469  PhoH family protein  42.19 
 
 		 469 aa  349  7e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5166  PhoH-like protein  43.2 
 
 		 600 aa  348  9e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0920  PhoH family protein  42.98 
 
 		 606 aa  348  9e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.115039  normal  0.244887 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1889  PhoH family protein  43.2 
 
 		 600 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.835175  hitchhiker  0.000000118582 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6214  PhoH-like protein  43.2 
 
 		 600 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1865  PhoH family protein  43.2 
 
 		 600 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1210  PhoH-like protein  43.46 
 
 		 473 aa  347  2e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3210  PhoH family protein  41.56 
 
 		 587 aa  346  5e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2563  PhoH family protein  41.56 
 
 		 587 aa  346  5e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.388197  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2235  PhoH family protein  41.28 
 
 		 561 aa  346  6e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0299193  hitchhiker  0.000000485186 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0413  PhoH family protein  43.43 
 
 		 472 aa  346  6e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.205876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1728  nucleotide binding protein  42.73 
 
 		 465 aa  345  7e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0561726  normal  0.608115 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2186  PhoH-like protein  41.59 
 
 		 562 aa  345  8e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.985404 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1316  hypothetical protein  42.4 
 
 		 572 aa  345  1e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1908  PhoH-like protein  41.29 
 
 		 605 aa  345  1e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1252  PhoH family protein  41.54 
 
 		 575 aa  342  9e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00804597  normal  0.72873 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1191  PhoH family protein  41.54 
 
 		 575 aa  342  1e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.171726  normal  0.0177982 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00130  PhoH family protein  42.06 
 
 		 465 aa  342  1e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.06025  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1946  PhoH-like protein  42.12 
 
 		 483 aa  341  2e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0987  PhoH family protein  42.42 
 
 		 575 aa  341  2e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.740963 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2582  PhoH family protein  41.76 
 
 		 492 aa  339  5e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1508  PhoH family protein  42.09 
 
 		 466 aa  339  5.9999999999999996e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.109703  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2754  hypothetical protein  41.33 
 
 		 468 aa  338  9e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2901  hypothetical protein  41.33 
 
 		 468 aa  338  9.999999999999999e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1970  PhoH-like protein  42.12 
 
 		 564 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.368565  normal  0.217357 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1827  PhoH family protein  41.04 
 
 		 595 aa  333  4e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298411  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1997  PhoH-like protein  42.12 
 
 		 567 aa  332  1e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1110  PhoH-like protein  42.25 
 
 		 522 aa  330  4e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.103342  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2481  PhoH family protein  39.27 
 
 		 450 aa  320  3.9999999999999996e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0342  hypothetical protein  41.36 
 
 		 450 aa  318  1e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0824  PhoH-like protein  40.69 
 
 		 474 aa  290  3e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0148  PhoH family protein  36.1 
 
 		 428 aa  274  2.0000000000000002e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000131616  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0022  PhoH family protein  37.77 
 
 		 442 aa  272  1e-71  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2279  phoH-related protein  36.62 
 
 		 451 aa  271  2e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.639212 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0425  PhoH family protein  37.53 
 
 		 418 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0440  PhoH family protein  37.31 
 
 		 418 aa  269  8e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10930  PhoH family protein  36.13 
 
 		 439 aa  261  2e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2290  PhoH family protein  35.21 
 
 		 440 aa  260  3e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0479  PhoH family protein  36.92 
 
 		 410 aa  261  3e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1933  PhoH family protein  35.85 
 
 		 440 aa  259  6e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>