More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2376 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012848  Rleg_5393  Aldehyde Dehydrogenase  71.4 
 
 
463 aa  681    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.587112  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2376  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
460 aa  937    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.976693  normal  0.747066 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3359  aldehyde dehydrogenase family protein  56.46 
 
 
475 aa  545  1e-154  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6113  Aldehyde Dehydrogenase  49.89 
 
 
466 aa  489  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401659  normal  0.835317 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0100  aldehyde dehydrogenase  56.25 
 
 
464 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0407141  normal  0.302016 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1493  Aldehyde Dehydrogenase  37.92 
 
 
477 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0589665  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0327  Aldehyde Dehydrogenase  38.8 
 
 
491 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2398  aldehyde dehydrogenase family protein  36.2 
 
 
474 aa  309  5e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2323  aldehyde dehydrogenase family protein  36.2 
 
 
474 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.489166  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1487  Aldehyde Dehydrogenase  36.68 
 
 
479 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0762  aldehyde dehydrogenase  36.68 
 
 
475 aa  308  2.0000000000000002e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.338463  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2073  succinic-semialdehyde dehydrogenase NAD(P)+  35.76 
 
 
474 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.578512  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2135  aldehyde dehydrogenase family protein  35.76 
 
 
474 aa  307  3e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.806044  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2314  aldehyde dehydrogenase family protein  35.76 
 
 
474 aa  307  3e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2289  aldehyde dehydrogenase family protein  35.76 
 
 
474 aa  307  3e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.896409  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2069  succinic-semialdehyde dehydrogenase NAD(P)+  35.76 
 
 
474 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2271  aldehyde dehydrogenase family protein  36.2 
 
 
474 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2108  aldehyde dehydrogenase  35.81 
 
 
474 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1239  Aldehyde Dehydrogenase  36.84 
 
 
494 aa  302  1e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0764  aldehyde dehydrogenase  35.1 
 
 
484 aa  301  2e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1309  aldehyde dehydrogenase  35.45 
 
 
477 aa  301  2e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.472659  normal  0.0179284 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1578  aldehyde dehydrogenase  36.18 
 
 
475 aa  300  3e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000814705  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3054  aldehyde dehydrogenase family protein  35.76 
 
 
474 aa  300  3e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1531  aldehyde dehydrogenase  38.67 
 
 
481 aa  299  8e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2752  Aldehyde Dehydrogenase  37.02 
 
 
475 aa  298  2e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1108  aldehyde dehydrogenase family protein  36.18 
 
 
475 aa  296  6e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00189493  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4339  Aldehyde Dehydrogenase  39.51 
 
 
482 aa  296  7e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.222249  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1421  aldehyde dehydrogenase  39.33 
 
 
490 aa  294  3e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.545693  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0484  Aldehyde Dehydrogenase  33.48 
 
 
464 aa  293  5e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0468  aldehyde dehydrogenase  37.69 
 
 
472 aa  293  5e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.523004 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0638  aldehyde dehydrogenase  36.3 
 
 
477 aa  288  1e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00666091  normal  0.103918 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3849  aldehyde dehydrogenase  37.36 
 
 
476 aa  287  2e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.987867  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2378  aldehyde dehydrogenase  37.23 
 
 
478 aa  286  4e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1037  aldehyde dehydrogenase  42.13 
 
 
481 aa  286  8e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.030007 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0868  Aldehyde Dehydrogenase  37.88 
 
 
484 aa  285  9e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0744  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  39.91 
 
 
496 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0497509  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00657  Aldehyde dehydrogenase  37.83 
 
 
475 aa  283  3.0000000000000004e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6531  aldehyde dehydrogenase  37.86 
 
 
481 aa  283  5.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0162128  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5291  Aldehyde Dehydrogenase  36.3 
 
 
475 aa  278  1e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2296  Aldehyde Dehydrogenase  38.11 
 
 
479 aa  277  3e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.190281 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0544  Aldehyde Dehydrogenase_  33.62 
 
 
477 aa  274  2.0000000000000002e-72  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.257528  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1075  Aldehyde Dehydrogenase  33.77 
 
 
475 aa  273  5.000000000000001e-72  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6798  aldehyde dehydrogenase  36.78 
 
 
476 aa  272  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.271512  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4960  Aldehyde Dehydrogenase  33.84 
 
 
469 aa  271  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.613851  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4843  aldehyde dehydrogenase  36.14 
 
 
476 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.840357  normal  0.214894 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5062  Aldehyde Dehydrogenase  34.93 
 
 
473 aa  268  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.338258  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0611  aldehyde dehydrogenase  36.68 
 
 
478 aa  267  2e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.25734  normal  0.381542 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4288  aldehyde dehydrogenase  36.39 
 
 
476 aa  266  4e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0354203  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2498  putative aldehyde dehydrogenase  36.28 
 
 
470 aa  263  3e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0796  aldehyde dehydrogenase  34.19 
 
 
465 aa  263  4e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1959  putative succinate-semialdehyde dehydrogenase  39.71 
 
 
473 aa  263  6e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.195174  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3490  aldehyde dehydrogenase  36.11 
 
 
477 aa  262  1e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0829  aldehyde dehydrogenase  35 
 
 
473 aa  261  2e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0312676  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1030  aldehyde dehydrogenase  32.07 
 
 
465 aa  259  9e-68  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0731  aldehyde dehydrogenase  32.17 
 
 
465 aa  258  2e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.774486  normal  0.292001 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4580  aldehyde dehydrogenase  34.77 
 
 
477 aa  257  3e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.204426  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3783  aldehyde dehydrogenase  34.77 
 
 
477 aa  257  3e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.152056  normal  0.465588 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0559  aldehyde dehydrogenase  36.41 
 
 
473 aa  257  4e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.088227  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5510  aldehyde dehydrogenase  35 
 
 
477 aa  257  4e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1187  aldehyde dehydrogenase  32.61 
 
 
465 aa  256  5e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0090  aldehyde dehydrogenase  31.96 
 
 
465 aa  256  6e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2311  aldehyde dehydrogenase  34.76 
 
 
477 aa  255  9e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3740  aldehyde dehydrogenase  34.53 
 
 
477 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.485189 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3675  aldehyde dehydrogenase  35 
 
 
477 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.622193 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0498  aldehyde dehydrogenase  35.48 
 
 
477 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2549  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  35.24 
 
 
477 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.617873  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0973  aldehyde dehydrogenase  35.24 
 
 
477 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2695  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  35.24 
 
 
477 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0213  aldehyde dehydrogenase  35.24 
 
 
477 aa  252  1e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1391  aldehyde dehydrogenase  35.24 
 
 
477 aa  252  1e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1588  aldehyde dehydrogenase  35.24 
 
 
477 aa  252  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0247  aldehyde dehydrogenase  35.24 
 
 
477 aa  252  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3825  aldehyde dehydrogenase  37.89 
 
 
480 aa  251  2e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.344076  normal  0.0683109 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0227  aldehyde dehydrogenase  37.09 
 
 
478 aa  251  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.436059  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1249  Aldehyde Dehydrogenase  34.84 
 
 
478 aa  249  7e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4949  aldehyde dehydrogenase  34.12 
 
 
477 aa  249  8e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3297  putative dehydrogenase  35.48 
 
 
478 aa  248  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.461732  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3561  aldehyde dehydrogenase  35.53 
 
 
464 aa  247  3e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2083  aldehyde dehydrogenase  32.54 
 
 
478 aa  244  3e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774453  normal  0.0850344 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0897  aldehyde dehydrogenase  39.09 
 
 
479 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0403101 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2500  aldehyde dehydrogenase  35.23 
 
 
475 aa  243  5e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8568  Aldehyde Dehydrogenase  33.04 
 
 
484 aa  243  6e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7826  Aldehyde Dehydrogenase  38.22 
 
 
481 aa  242  7.999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1774  aldehyde dehydrogenase  31.9 
 
 
480 aa  241  2e-62  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00658035  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1119  aldehyde dehydrogenase  34.84 
 
 
478 aa  240  4e-62  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.193972  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0665  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent,putative  32.47 
 
 
472 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2434  NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  34.71 
 
 
482 aa  237  3e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0959  aldehyde dehydrogenase  38.37 
 
 
487 aa  237  4e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.402703 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0699  aldehyde dehydrogenase  32.68 
 
 
472 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0351901  hitchhiker  0.00852309 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1899  aldehyde dehydrogenase  32.77 
 
 
471 aa  236  8e-61  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2748  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  34.47 
 
 
482 aa  236  9e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0073  aldehyde dehydrogenase  31.89 
 
 
468 aa  235  1.0000000000000001e-60  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1720  Aldehyde Dehydrogenase  39.32 
 
 
477 aa  234  3e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0907  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  33.48 
 
 
490 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.140416  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2170  aldehyde dehydrogenase family protein  33.48 
 
 
517 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.212122  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0815  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  33.48 
 
 
490 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.402156  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3628  Aldehyde Dehydrogenase  38.46 
 
 
474 aa  230  4e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0249  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  34.51 
 
 
473 aa  229  6e-59  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0814  Aldehyde Dehydrogenase  33.33 
 
 
480 aa  228  2e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0306  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.03 
 
 
483 aa  227  4e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>