More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0100 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_0100  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
464 aa  922    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0407141  normal  0.302016 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3359  aldehyde dehydrogenase family protein  53.61 
 
 
475 aa  519  1e-146  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2376  aldehyde dehydrogenase  52.94 
 
 
460 aa  460  9.999999999999999e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.976693  normal  0.747066 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5393  Aldehyde Dehydrogenase  50.22 
 
 
463 aa  451  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.587112  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6113  Aldehyde Dehydrogenase  48.7 
 
 
466 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401659  normal  0.835317 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1487  Aldehyde Dehydrogenase  37.25 
 
 
479 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0468  aldehyde dehydrogenase  39.7 
 
 
472 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.523004 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2752  Aldehyde Dehydrogenase  37.96 
 
 
475 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0762  aldehyde dehydrogenase  36.4 
 
 
475 aa  296  4e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.338463  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1239  Aldehyde Dehydrogenase  36.98 
 
 
494 aa  291  1e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1108  aldehyde dehydrogenase family protein  36.32 
 
 
475 aa  289  7e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00189493  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1493  Aldehyde Dehydrogenase  35.54 
 
 
477 aa  289  7e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0589665  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1578  aldehyde dehydrogenase  34.86 
 
 
475 aa  288  1e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000814705  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1309  aldehyde dehydrogenase  37.32 
 
 
477 aa  287  2.9999999999999996e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.472659  normal  0.0179284 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1037  aldehyde dehydrogenase  40.97 
 
 
481 aa  286  7e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.030007 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4339  Aldehyde Dehydrogenase  39.69 
 
 
482 aa  285  9e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.222249  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2108  aldehyde dehydrogenase  34.72 
 
 
474 aa  281  1e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2323  aldehyde dehydrogenase family protein  35.6 
 
 
474 aa  281  2e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.489166  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2073  succinic-semialdehyde dehydrogenase NAD(P)+  35.68 
 
 
474 aa  281  2e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.578512  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1421  aldehyde dehydrogenase  40.82 
 
 
490 aa  281  2e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.545693  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2135  aldehyde dehydrogenase family protein  35.68 
 
 
474 aa  280  3e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.806044  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2289  aldehyde dehydrogenase family protein  35.68 
 
 
474 aa  280  3e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.896409  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2314  aldehyde dehydrogenase family protein  35.68 
 
 
474 aa  280  3e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0484  Aldehyde Dehydrogenase  33.84 
 
 
464 aa  280  3e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1531  aldehyde dehydrogenase  36.24 
 
 
481 aa  280  4e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2271  aldehyde dehydrogenase family protein  35.46 
 
 
474 aa  280  5e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2069  succinic-semialdehyde dehydrogenase NAD(P)+  35.46 
 
 
474 aa  280  6e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2398  aldehyde dehydrogenase family protein  35.24 
 
 
474 aa  276  6e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6531  aldehyde dehydrogenase  37.66 
 
 
481 aa  275  9e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0162128  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1075  Aldehyde Dehydrogenase  34.58 
 
 
475 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0764  aldehyde dehydrogenase  34.73 
 
 
484 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3054  aldehyde dehydrogenase family protein  36.1 
 
 
474 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0744  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  39.17 
 
 
496 aa  272  1e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0497509  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00657  Aldehyde dehydrogenase  36.71 
 
 
475 aa  272  1e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4960  Aldehyde Dehydrogenase  34.2 
 
 
469 aa  270  5e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.613851  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3849  aldehyde dehydrogenase  36.24 
 
 
476 aa  269  8e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.987867  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2378  aldehyde dehydrogenase  38 
 
 
478 aa  267  2.9999999999999995e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0327  Aldehyde Dehydrogenase  36.96 
 
 
491 aa  267  4e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0638  aldehyde dehydrogenase  37.44 
 
 
477 aa  267  4e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00666091  normal  0.103918 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5291  Aldehyde Dehydrogenase  36.73 
 
 
475 aa  266  5.999999999999999e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0544  Aldehyde Dehydrogenase_  32.6 
 
 
477 aa  266  8e-70  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.257528  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1959  putative succinate-semialdehyde dehydrogenase  40.96 
 
 
473 aa  265  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.195174  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3825  aldehyde dehydrogenase  37.96 
 
 
480 aa  264  2e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.344076  normal  0.0683109 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0829  aldehyde dehydrogenase  35.13 
 
 
473 aa  264  3e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0312676  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2500  aldehyde dehydrogenase  39.38 
 
 
475 aa  263  3e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4843  aldehyde dehydrogenase  35.82 
 
 
476 aa  260  4e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.840357  normal  0.214894 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2498  putative aldehyde dehydrogenase  37.41 
 
 
470 aa  260  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2296  Aldehyde Dehydrogenase  39.66 
 
 
479 aa  259  7e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.190281 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4288  aldehyde dehydrogenase  35.73 
 
 
476 aa  257  3e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0354203  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5062  Aldehyde Dehydrogenase  33.7 
 
 
473 aa  256  5e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.338258  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6798  aldehyde dehydrogenase  35.16 
 
 
476 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.271512  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8568  Aldehyde Dehydrogenase  36.76 
 
 
484 aa  256  6e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4580  aldehyde dehydrogenase  37.12 
 
 
477 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.204426  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3783  aldehyde dehydrogenase  37.12 
 
 
477 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.152056  normal  0.465588 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3740  aldehyde dehydrogenase  37.12 
 
 
477 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.485189 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5510  aldehyde dehydrogenase  36.64 
 
 
477 aa  254  3e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2311  aldehyde dehydrogenase  36.88 
 
 
477 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0559  aldehyde dehydrogenase  37.55 
 
 
473 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.088227  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0498  aldehyde dehydrogenase  37.44 
 
 
477 aa  253  6e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4949  aldehyde dehydrogenase  36.41 
 
 
477 aa  253  6e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1720  Aldehyde Dehydrogenase  39.52 
 
 
477 aa  253  7e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0973  aldehyde dehydrogenase  37.12 
 
 
477 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2549  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  37.12 
 
 
477 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.617873  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2695  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  37.12 
 
 
477 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1391  aldehyde dehydrogenase  37.12 
 
 
477 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0213  aldehyde dehydrogenase  37.12 
 
 
477 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0247  aldehyde dehydrogenase  37.12 
 
 
477 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1588  aldehyde dehydrogenase  37.12 
 
 
477 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3675  aldehyde dehydrogenase  36.41 
 
 
477 aa  250  3e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.622193 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0897  aldehyde dehydrogenase  40.34 
 
 
479 aa  248  2e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0403101 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0699  aldehyde dehydrogenase  35.65 
 
 
472 aa  246  8e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0351901  hitchhiker  0.00852309 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0665  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent,putative  35.65 
 
 
472 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1774  aldehyde dehydrogenase  34.4 
 
 
480 aa  244  1.9999999999999999e-63  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00658035  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0227  aldehyde dehydrogenase  38 
 
 
478 aa  243  5e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.436059  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7826  Aldehyde Dehydrogenase  37.96 
 
 
481 aa  243  5e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2083  aldehyde dehydrogenase  35.55 
 
 
478 aa  242  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774453  normal  0.0850344 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0868  Aldehyde Dehydrogenase  33.76 
 
 
484 aa  241  1e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0814  Aldehyde Dehydrogenase  36.02 
 
 
480 aa  240  5e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3490  aldehyde dehydrogenase  37.23 
 
 
477 aa  239  1e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3561  aldehyde dehydrogenase  35.38 
 
 
464 aa  238  2e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0796  aldehyde dehydrogenase  30.97 
 
 
465 aa  237  3e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0611  aldehyde dehydrogenase  36.75 
 
 
478 aa  237  4e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.25734  normal  0.381542 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0073  aldehyde dehydrogenase  33.33 
 
 
468 aa  236  8e-61  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1360  Aldehyde Dehydrogenase  38.9 
 
 
482 aa  236  8e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.751773  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0554  aldehyde dehydrogenase  33.11 
 
 
476 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  unclonable  0.000000239131  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1030  aldehyde dehydrogenase  29.22 
 
 
465 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1249  Aldehyde Dehydrogenase  35.03 
 
 
478 aa  234  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3297  putative dehydrogenase  35.27 
 
 
478 aa  234  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.461732  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0090  aldehyde dehydrogenase  30.09 
 
 
465 aa  233  7.000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0898  aldehyde dehydrogenase  38.86 
 
 
565 aa  233  8.000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.120021 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0959  aldehyde dehydrogenase  37.63 
 
 
487 aa  231  2e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.402703 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2434  NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  30.79 
 
 
482 aa  230  3e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2748  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  30.79 
 
 
482 aa  229  6e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3628  Aldehyde Dehydrogenase  37.42 
 
 
474 aa  229  9e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0401  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  33.69 
 
 
483 aa  228  1e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00719001  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0299  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  33.91 
 
 
483 aa  228  2e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0359  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  33.91 
 
 
483 aa  228  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4947  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  33.69 
 
 
483 aa  228  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1187  aldehyde dehydrogenase  29.87 
 
 
465 aa  228  3e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0373  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  33.33 
 
 
483 aa  227  3e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>