53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2866 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2866  hypothetical protein  100 
 
 		 207 aa  429  1e-119  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3138  hypothetical protein  33 
 
 		 210 aa  116  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000486476  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2045  hypothetical protein  28.79 
 
 		 214 aa  102  5e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2460  hypothetical protein  29.56 
 
 		 208 aa  96.7  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.66442  normal  0.0198742 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0223  hypothetical protein  24.75 
 
 		 213 aa  92  5e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1903  hypothetical protein  24 
 
 		 207 aa  87.4  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0942609 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1894  hypothetical protein  23.15 
 
 		 207 aa  85.9  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.510303  hitchhiker  0.000733658 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3130  hypothetical protein  23.79 
 
 		 208 aa  85.1  7e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06129  uroporphyrinogen decarboxylase  50.67 
 
 		 82 aa  83.6  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000325  hypothetical protein  47.44 
 
 		 81 aa  82.4  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.681006  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0464  hypothetical protein  50 
 
 		 84 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0681  hypothetical protein  46.05 
 
 		 83 aa  79.3  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.657209  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3199  hypothetical protein  43.75 
 
 		 82 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3892  uroporphyrinogen decarboxylase  50.72 
 
 		 99 aa  72  0.000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.186301  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0422  uroporphyrinogen decarboxylase  49.3 
 
 		 84 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0448  hypothetical protein  49.3 
 
 		 82 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0434  uroporphyrinogen decarboxylase  49.3 
 
 		 84 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0431755  hitchhiker  0.00188375 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0509  hypothetical protein  49.3 
 
 		 84 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4196  hypothetical protein  50.72 
 
 		 82 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3722  uroporphyrinogen decarboxylase  50.72 
 
 		 84 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.168945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0408  hypothetical protein  49.28 
 
 		 84 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0042697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3548  hypothetical protein  49.28 
 
 		 84 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00713836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4093  hypothetical protein  47.89 
 
 		 82 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3091  hypothetical protein  44.29 
 
 		 85 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0478  hypothetical protein  45.71 
 
 		 82 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0531  hypothetical protein  46.48 
 
 		 82 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0637  hypothetical protein  44.29 
 
 		 84 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3369  hypothetical protein  43.66 
 
 		 84 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.926269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3789  hypothetical protein  44.59 
 
 		 83 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0562  hypothetical protein  47.14 
 
 		 80 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3007  hypothetical protein  50 
 
 		 75 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0169292  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2943  hypothetical protein  45.71 
 
 		 79 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0587725 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3030  hypothetical protein  48.53 
 
 		 81 aa  64.3  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.474909 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3941  hypothetical protein  42.86 
 
 		 79 aa  63.9  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.941629  normal  0.273389 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3393  hypothetical protein  45.71 
 
 		 80 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1069  hypothetical protein  47.14 
 
 		 75 aa  63.9  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3882  hypothetical protein  44.93 
 
 		 92 aa  63.5  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.75792  hitchhiker  0.00000229094 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3469  hypothetical protein  45.71 
 
 		 80 aa  63.2  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.652617  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3592  hypothetical protein  45.71 
 
 		 80 aa  63.2  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0893  hypothetical protein  45.71 
 
 		 80 aa  63.2  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3191  hypothetical protein  43.48 
 
 		 83 aa  60.8  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.107288  normal  0.334756 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0907  hypothetical protein  47.06 
 
 		 81 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.495261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0944  hypothetical protein  45.71 
 
 		 81 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.225877  normal  0.316491 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01580  hypothetical protein  36.76 
 
 		 72 aa  56.2  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.577679  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3680  hypothetical protein  43.59 
 
 		 82 aa  55.1  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2505  hypothetical protein  35.94 
 
 		 86 aa  48.9  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.279612  normal  0.630459 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2689  cyclic nucleotide-binding protein  31.43 
 
 		 208 aa  48.1  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.0072891  normal  0.636365 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0576  cyclic nucleotide-binding  25 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.315995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1668  cyclic nucleotide-binding protein  22.22 
 
 		 209 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.796246  normal  0.637535 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0550  cyclic nucleotide-binding protein  25 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.844847 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0586  cyclic nucleotide-binding protein  25 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0772  uroporphyrinogen decarboxylase  29.58 
 
 		 72 aa  42.4  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1049  cyclic nucleotide-binding protein  24.29 
 
 		 210 aa  42  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.085615  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>