49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3199 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3199  hypothetical protein  100 
 
 		 82 aa  167  4e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0448  hypothetical protein  79.27 
 
 		 82 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0434  uroporphyrinogen decarboxylase  79.27 
 
 		 84 aa  137  6e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0431755  hitchhiker  0.00188375 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0422  uroporphyrinogen decarboxylase  79.27 
 
 		 84 aa  137  6e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3892  uroporphyrinogen decarboxylase  79.27 
 
 		 99 aa  136  7e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.186301  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4196  hypothetical protein  79.27 
 
 		 82 aa  135  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3722  uroporphyrinogen decarboxylase  79.27 
 
 		 84 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.168945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3548  hypothetical protein  78.05 
 
 		 84 aa  134  4e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00713836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0408  hypothetical protein  78.05 
 
 		 84 aa  134  4e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0042697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4093  hypothetical protein  76.83 
 
 		 82 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0478  hypothetical protein  76.83 
 
 		 82 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0509  hypothetical protein  76.83 
 
 		 84 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0531  hypothetical protein  73.17 
 
 		 82 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3789  hypothetical protein  73.17 
 
 		 83 aa  128  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3369  hypothetical protein  76.62 
 
 		 84 aa  128  3e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.926269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0464  hypothetical protein  76.83 
 
 		 84 aa  121  3e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06129  uroporphyrinogen decarboxylase  57.14 
 
 		 82 aa  97.4  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000325  hypothetical protein  59.72 
 
 		 81 aa  96.7  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.681006  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0681  hypothetical protein  56.58 
 
 		 83 aa  95.5  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.657209  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1069  hypothetical protein  59.72 
 
 		 75 aa  86.7  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3007  hypothetical protein  60.27 
 
 		 75 aa  85.5  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0169292  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0562  hypothetical protein  55.13 
 
 		 80 aa  84.7  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3091  hypothetical protein  58.44 
 
 		 85 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3393  hypothetical protein  59.72 
 
 		 80 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0907  hypothetical protein  56.58 
 
 		 81 aa  82  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.495261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3030  hypothetical protein  55 
 
 		 81 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.474909 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0893  hypothetical protein  54.43 
 
 		 80 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2943  hypothetical protein  58.9 
 
 		 79 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0587725 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3592  hypothetical protein  54.43 
 
 		 80 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3469  hypothetical protein  54.43 
 
 		 80 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.652617  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0944  hypothetical protein  53.85 
 
 		 81 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.225877  normal  0.316491 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0637  hypothetical protein  54.55 
 
 		 84 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3941  hypothetical protein  54.43 
 
 		 79 aa  78.6  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.941629  normal  0.273389 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3882  hypothetical protein  53.33 
 
 		 92 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.75792  hitchhiker  0.00000229094 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3191  hypothetical protein  52.56 
 
 		 83 aa  77  0.00000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.107288  normal  0.334756 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3680  hypothetical protein  50 
 
 		 82 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2866  hypothetical protein  43.75 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2505  hypothetical protein  41.43 
 
 		 86 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.279612  normal  0.630459 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2460  hypothetical protein  42.67 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.66442  normal  0.0198742 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3138  hypothetical protein  40.58 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000486476  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0772  uroporphyrinogen decarboxylase  38.03 
 
 		 72 aa  58.2  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1894  hypothetical protein  32.47 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.510303  hitchhiker  0.000733658 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2045  hypothetical protein  36.62 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01580  hypothetical protein  37.88 
 
 		 72 aa  54.7  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.577679  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1903  hypothetical protein  36.92 
 
 		 207 aa  52  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0942609 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0223  hypothetical protein  37.14 
 
 		 213 aa  51.6  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3130  hypothetical protein  24.66 
 
 		 208 aa  46.2  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2172  hypothetical protein  33.8 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.722768  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1853  hypothetical protein  24.36 
 
 		 100 aa  40.4  0.009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>